Đây là lệnh fsl-5.0-core có thể chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
fsl - công cụ phân tích cho hình ảnh não FMRI, MRI và DTI
MÔ TẢ
FSL là một bộ công cụ toàn diện để phân tích dữ liệu hình ảnh não y tế. Nó
cung cấp các công cụ để xử lý trước dữ liệu, trích xuất não, đăng ký hình ảnh cũng như
phổ rộng của các phân tích thống kê. FSL cung cấp một GUI dễ sử dụng.
FSL yêu cầu một số biến môi trường phải được đặt đúng cách. Để đạt được điều này,
vui lòng mã nguồn tập lệnh cấu hình từ /etc/fsl/5.0/fsl.sh. Một cách để làm điều này
tự động là thêm một dòng chứa
. /etc/fsl/5.0/fsl.sh
vào tệp .bashrc trong thư mục chính của người dùng (hoặc tệp tương ứng cho các trình bao khác
hơn bash). Bạn có thể cần phải tạo một tệp như vậy trước.
Ngoài ra, gói Debian cài đặt các liên kết tượng trưng cho tất cả các công cụ FSL trong / usr / bin việc này
đảm nhận việc tải cấu hình thích hợp một cách tự động. Các tên liên kết biểu tượng là
tiền tố tương ứng với FSL phiên bản để ngăn chặn xung đột tên tệp và cho phép
nhiều phiên bản để cùng tồn tại trên cùng một hệ thống. Ví dụ, máy thái lệnh là
có sẵn như fsl5.0-máy cắt. Hãy lưu ý rằng để sử dụng FSL các công cụ thông qua các liên kết tượng trưng này
không cần thiết để thực hiện quy trình thiết lập được mô tả ở trên. Tuy nhiên, sự tiện lợi này
tính năng dành riêng cho Debian. Các tập lệnh sử dụng các lệnh FSL và nhằm mục đích chia sẻ
với những người khác nên dựa vào tên lệnh không được định sẵn và biến môi trường FSL
thành lập.
Sản phẩm FSL giao diện người dùng đôi khi đề cập đến một FSLDIR. Trên hệ thống Debian, đây là
/usr/share/fsl/5.0 cho FSL phiên bản 5.0.
FSL tài liệu và trợ giúp trực tuyến được cung cấp bởi fsl-5.0-doc Gói.
Các câu hỏi liên quan đến việc sử dụng FSL hoặc lý thuyết liên quan có thể được đăng trên FSL gửi thư
(xem http://www.jiscmail.ac.uk/lists/fsl.html).
CỔ PHẦN HÓA
FSL có thể được định cấu hình để gửi công việc tới Sun Gridengine (SGE) đang chạy. Trong khi không phải tất cả
chức năng được triển khai trong FSL hỗ trợ loại song song này, đòi hỏi khắt khe nhất
các công cụ xử lý (ví dụ như POSSUM và FDT) làm được.
FSL sẽ có thể sử dụng SGE ngay cả khi biến môi trường SGE_ROOT không được đặt, như trong
trường hợp gói Debian của SGE. Để kích hoạt xử lý hàng loạt, chỉ cần đặt
FSLPARALLEL = 1
trong shell nơi FSL đang chạy. Điều này có thể được bật vĩnh viễn trong
/etc/fsl/5.0/fsl.sh
hoặc theo từng trường hợp cụ thể.
Sử dụng trực tuyến fsl-5.0-core bằng các dịch vụ onworks.net
