Đây là lệnh hmmconvert có thể được chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi, chẳng hạn như Ubuntu Online, Fedora Online, trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
hmmconvert - chuyển đổi tệp hồ sơ sang định dạng HMMER
SYNOPSIS
hừm chuyển đổi [tùy chọn]
MÔ TẢ
Sản phẩm hừm chuyển đổi tiện ích chuyển đổi tệp hồ sơ đầu vào sang các định dạng HMMER khác nhau.
Theo mặc định, cấu hình đầu vào có thể ở bất kỳ định dạng HMMER nào, bao gồm cả các định dạng cũ / lỗi thời
từ HMMER2, ASCII hoặc nhị phân; cấu hình đầu ra là định dạng HMMER3 ASCII hiện tại.
có thể là '-' (gạch ngang), có nghĩa là đọc đầu vào này từ tiêu chuẩn chứ không phải là một tệp.
LỰA CHỌN
-h Cứu giúp; in lời nhắc ngắn gọn về việc sử dụng dòng lệnh và tất cả các tùy chọn có sẵn.
-a Kết xuất hồ sơ ở định dạng văn bản ASCII. Đây là mặc định.
-b Cấu hình đầu ra ở định dạng nhị phân.
-2 Đầu ra ở định dạng văn bản HMMER2 ASCII kế thừa, ở chế độ ls (glocal). Điều này cho phép HMMER3
các mô hình được chuyển đổi trở lại thành giá trị gần đúng của HMMER2, để so sánh
nghiên cứu.
--outfmt
Đầu ra ở định dạng văn bản HMMER3 ASCII khác với định dạng mới nhất. Có giá trị
lựa chọn cho là 3 / a đến 3 / f. Định dạng hiện tại là 3 / f và đây là
vỡ nợ. Định dạng 3 / b đã được sử dụng trong bản phát hành HMMER3 chính thức và các định dạng khác
đã được sử dụng trong các phiên bản thử nghiệm khác nhau.
Sử dụng hmmconvert trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net
