Đây là lệnh indigo-cano có thể chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình mô phỏng trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
indigo-cano - tạo SMILES chuẩn hoặc mã phân lớp cho các phân tử ở định dạng MOL hoặc SDF
SYNOPSIS
màu chàm tên tệp.{mol,rdf,rdf.gz,sdf,sdf.gz,smi} [thông số]
màu chàm - SMILES [thông số]
MÔ TẢ
màu chàm được sử dụng để tạo ra SMILES chính tắc hoặc mã phân lớp cho các phân tử trong MOL hoặc
định dạng SDF.
LỰA CHỌN
màu chàm mong đợi một tệp hoặc mã SMILES trên đầu vào tiêu chuẩn, khi đó có thể
theo sau bởi một hoặc nhiều tham số sau.
-mỉm cười
Xuất ra SMILES chuẩn (mặc định)
- nhiều lớp
Xuất mã lớp chuẩn
-Tôi
Trường ID có tên đã cho trong tệp SDF
-không có mùi thơm
Không làm thơm các phân tử
-không có tứ diện
Bỏ qua các tâm lập thể tứ diện
-no-cistrans
Bỏ qua thông tin liên kết cis-trans
VÍ DỤ
màu chàm infile.sdf
màu chàm infile.sdf.gz -Tôi molregno > kết quả.txt
màu chàm infile.smi - nhiều lớp -no-cistrans
màu chàm - 'NC1C=CC(O)=CC=1'
Sử dụng indigo-cano trực tuyến bằng dịch vụ onworks.net
