Đây là lệnh indigo-deco có thể chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình mô phỏng trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
indigo-deco - phát hiện giàn giáo phân tử và giải mã nhóm R
SYNOPSIS
màu chàm các tập tin [thông số]
màu chàm -h
MÔ TẢ
màu chàm phát hiện giàn giáo phân tử và giải mã nhóm R. Đã được chấp nhận
các định dạng là: Molfile, SDFile, RDFile, SMILES và CML.
LỰA CHỌN
màu chàm chấp nhận các tham số sau.
-h In thông báo trợ giúp
-a Tính toán giàn giáo gần đúng (mặc định là chính xác)
-s
Viết giàn giáo tối đa được tìm thấy vào molfile
-S
Ghi tất cả các giàn giáo được tìm thấy vào tệp SD
-l
Không tính toán giàn giáo mà tải nó từ tệp
-sr
Viết giàn giáo với các trang R vào một tập tin
-o
Viết kết quả các phân tử được đánh dấu vào tập tin
-r
Viết các phân tử thu được với các nhóm r riêng biệt vào hồ sơ
tạo Không có sự cân nhắc về hương thơm
-- Đánh dấu sự kết thúc của các lựa chọn
VÍ DỤ
màu chàm *.mol -o hl.sdf -s scaf.sdf
Đọc các phân tử từ molfiles trong thư mục hiện tại, lưu giàn giáo tối đa được tìm thấy
vào scaf.mol và lưu các phân tử được đánh dấu vào hl.sdf.
màu chàm cấu trúc.mol nhiều.sdf -s scaf.mol -S allscafs.sdf -r rg.sdf
Đọc một phân tử từ Structure.mol và nhiều phân tử từ many.sdf, lưu lại
các phân tử có r-rgoups vào rg.sdf và lưu tất cả các giàn giáo được tìm thấy vào allscafs.sdf.
màu chàm *.smi -d sẵn sàng.mol -o hl.sdf
Đọc nhiều phân tử từ mọi tệp SMILES trong thư mục hiện tại, đọc
giàn giáo từ Readyscaf.mol và lưu các phân tử được đánh dấu vào hl.sdf.
Sử dụng indigo-deco trực tuyến bằng dịch vụ onworks.net
