Đây là lệnh masai_output_pe có thể chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
masai_output_pe - Đầu ra Masai - Chế độ kết thúc ghép nối
SYNOPSIS
masai_output_pe [TÙY CHỌN]
MÔ TẢ
Masai là công cụ lập bản đồ đọc nhanh và chính xác dựa trên các hạt và bội số gần đúng
quay lưng lại.
Xem http://www.seqan.de/projects/masai để biết thêm thông tin chi tiết.
(c) Bản quyền 2011-2012 của Enrico Siragusa.
-h, --Cứu giúp
Hiển thị thông báo trợ giúp này.
--phiên bản
Thông tin phiên bản màn hình hiển thị
Các tùy chọn ghép nối:
-ng, --không gấp khúc
Không căn chỉnh các lần đọc với các khoảng trống.
-NS, - độ dài thư viện NUM
Chiều dài thư viện. Mặc định: 220.
-NS, - lỗi thư viện NUM
Dung sai độ dài thư viện. Mặc định: 50.
Tùy chọn đầu ra:
-t, --tmp-thư mục STR
Chỉ định một thư mục tạm thời rất lớn. Mặc định: sử dụng thư mục bộ gen.
-o, --output-tệp FILE
Chỉ định một tệp đầu ra. Mặc định: sử dụng tiền tố tên tệp đọc. Các loại tệp hợp lệ
là: nguyên và sam.
-nc, --không có điếu xì gà
Không xuất ra chuỗi CIGAR. Điều này chỉ ảnh hưởng đến đầu ra SAM.
Tùy chọn gỡ lỗi:
-NS, --không đổ
Không đổ kết quả.
PHIÊN BẢN
Phiên bản masai_output_pe: 0.7.1 [14053] Cập nhật lần cuối 2013-05-16
Sử dụng masai_output_pe trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net
