mincaverage - Trực tuyến trên đám mây

CHƯƠNG TRÌNH:

TÊN

mincaverage - tệp minc trung bình

SYNOPSIS

tối thiểu [ ] .mnc [ .mnc ...] .mnc

MÔ TẢ

Mức tối thiểu tính trung bình các tệp minc với nhau. Một loạt các hành vi tùy chọn được cho phép như
tốt: chuẩn hóa trước khối lượng, tạo khối lượng lệch chuẩn, tính trung bình trên một
kích thước cụ thể của các tệp đầu vào.

LỰA CHỌN

Lưu ý rằng các tùy chọn có thể được chỉ định ở dạng viết tắt (miễn là chúng là duy nhất) và
có thể được cung cấp ở bất kỳ đâu trên dòng lệnh.

Tổng Quát lựa chọn

-2 Tạo tệp đầu ra định dạng MINC 2.0.

-có khăn
Ghi đè một tệp hiện có.

-noclobber
Không ghi đè lên tệp hiện có (mặc định).

-bèo thuyền
In thông tin tiến độ cho từng đoạn dữ liệu được sao chép (mặc định).

-Yên lặng Không in ra thông tin tiến độ.

-gỡ lỗi In thông tin bổ sung (ví dụ: các hệ số chuẩn hóa).

-nhà phim tên tập tin
Chỉ định một tệp chứa danh sách tên tệp đầu vào. Nếu "-" được đưa ra, thì tệp
tên được đọc từ stdin. Nếu tùy chọn này được đưa ra, thì sẽ không có đầu vào
tên tệp được chỉ định trên dòng lệnh. Các dòng trống trong tệp đầu vào là
mặc kệ.

-max_buffer_size_in_kb kích thước bộ đệm
Chỉ định kích thước tối đa của bộ đệm bên trong (tính bằng kbyte). Mặc định là 4096
kbyte.

Đầu ra kiểu lựa chọn

Các tùy chọn này kiểm soát độ chính xác lưu trữ và kích thước của các giá trị voxel riêng lẻ trong
tập tin đầu ra.

-loại tệp
Không thực hiện bất kỳ chuyển đổi loại nào (mặc định).

-byte Viết ra các giá trị số nguyên 8 bit.

-ngắn Viết ra các giá trị số nguyên 16 bit.

-NS Viết ra các giá trị số nguyên 32 bit.

-Dài Được thay thế bởi -int.

-Phao nổi Viết ra các giá trị dấu chấm động chính xác đơn.

-gấp đôi
Viết ra các giá trị dấu chấm động có độ chính xác kép.

-đã ký Viết ra các giá trị dưới dạng số nguyên có dấu (mặc định cho ngắn và dài). Bỏ qua cho
các loại dấu phẩy động.

-chưa ký
Viết ra các giá trị dưới dạng số nguyên không dấu (mặc định cho byte). Bỏ qua vì thả nổi
các loại điểm.

-phạm vi phút tối đa
chỉ định phạm vi hợp lệ của giá trị voxel đầu ra trong biểu diễn số nguyên của chúng.
Mặc định là phạm vi đầy đủ cho loại và ký hiệu. Tùy chọn này bị bỏ qua đối với
các giá trị dấu phẩy động. Để nó có bất kỳ tác dụng nào, bạn phải chỉ định một loại.

Trung bình lựa chọn

- chuẩn hóa
Chuẩn hóa khối lượng thành mức trung bình toàn cầu trước khi tính trung bình (dựa trên giá trị trung bình
của voxels có giá trị lớn hơn 2 phần trăm của toàn dải cao hơn mức tối thiểu).

- chuẩn hóa
Không chuẩn hóa khối lượng (mặc định).

-sdfile sdfile.mnc
Chỉ định tên của tệp độ lệch chuẩn đầu ra, được tính thêm vào
giá trị trung bình thường được tính toán.

-tệp trọng lượng trọng lượngfile.mnc
Chỉ định một tệp trọng lượng voxel tích lũy đầu ra (mặc định = không có).

-copy_header
Sao chép tất cả thông tin tiêu đề bổ sung từ tệp đầu vào đầu tiên (mặc định
cho một tệp đầu vào).

-nocopy_header
Không sao chép thông tin tiêu đề bổ sung (mặc định cho nhiều tệp đầu vào).

-avgdim tên mờ
Chỉ định tên của thứ nguyên mà chúng ta nên lấy giá trị trung bình (hoặc tính toán
độ lệch chuẩn). Nếu quá trình chuẩn hóa được thực hiện, nó vẫn chỉ áp dụng cho
chỉ các tệp - không có quá trình chuẩn hóa nào được thực hiện trong một tệp.

-nhị phân hóa
Binarize các khối lượng đầu vào trước khi tính giá trị trung bình. Quá trình mã hóa nhị phân được thực hiện
bằng cách chỉ định một loạt giá trị đóng góp 1 vào giá trị trung bình. Bình thường hóa
đầu vào không được phép khi thực hiện mã hóa nhị phân.

-phạm vi bin phút tối đa
Chỉ định phạm vi giá trị cho mã nhị phân.

-giá trị giá trị
Chỉ định một giá trị pháp lý duy nhất (số nguyên) cho mã nhị phân. Phạm vi được đặt thành +/-
0.5 xung quanh giá trị này để đạt được hiệu quả làm tròn các giá trị đầu vào.

-bỏ_dưới giá trị
Không bao gồm voxels dưới giá trị này trong giá trị trung bình và sd

-bỏ qua_ở trên giá trị
Không bao gồm voxels trên giá trị này trong giá trị trung bình và sd

-sàn nhà giá trị
Từ đồng nghĩa với -bỏ_dưới

-bỏ qua_ở trên giá trị
Từ đồng nghĩa với -bỏ qua_ở trên

-trọng lượng
Chỉ định một loạt các trọng số để tính trung bình. Số lượng giá trị trọng số phải
khớp với số lượng tệp đầu vào và các giá trị phải được cung cấp dưới dạng một
đối số với dấu phẩy hoặc dấu cách làm dấu phân cách. Tổng các trọng số phải không
số không. Nếu trọng số được sử dụng với thứ nguyên trung bình, thì chỉ một tệp đầu vào có thể
được chỉ định.

-width_weighted
Tùy chọn này chỉ có thể được sử dụng khi tính trung bình trên một thứ nguyên (-avgdim Lựa chọn). Nó
chỉ định rằng trọng số phải được thực hiện bằng cách sử dụng biến chiều rộng tương ứng
sang thứ nguyên trung bình. Ví dụ, sử dụng -width_weighted với -avgdim thời gian
sẽ sử dụng biến chiều rộng thời gian để cân các giá trị.

-min_weight giá trị
Điều này chỉ định trọng lượng tối thiểu (số lượng thể tích nếu không có trọng lượng nào được chỉ định)
cần thiết để tính giá trị trung bình hợp lệ. Nếu trọng lượng tích lũy cho một voxel là
dưới ngưỡng này, mức trung bình và sd được báo cáo sẽ là 0. Điều này thường sẽ
hữu ích nếu các giá trị bị loại trừ bằng cách sử dụng bất kỳ -phớt lờ tùy chọn hoặc theo giá trị NaN
trong (các) âm lượng đầu vào.

-min_trọng lượng_phân số giá trị
Giống như -min_weight, nhưng được chỉ định dưới dạng một phần của tổng trọng số đầu vào
(hoặc số lượng khối lượng đầu vào, nếu không có trọng lượng nào được chỉ định).

Chung lựa chọn cho tất cả các lệnh:

-Cứu giúp In tóm tắt các tùy chọn dòng lệnh và thoát.

-phiên bản
In số phiên bản của chương trình và thoát.

Sử dụng mức tối thiểu trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net