Đây là lệnh TransDecoder.LongOrfs có thể được chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình giả lập trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
Transdecoder.LongOrfs - Dự đoán protein phiên mã
SỬ DỤNG
Cần thiết:
-NS transcriptts.fasta
Tùy chọn:
-NS chiều dài protein tối thiểu (mặc định: 100)
-NS mã di truyền (mặc định: phổ quát; xem PerlDoc; các tùy chọn: Euplotes, Tetrahymena, Candida, Acetabularia)
-S cụ thể về sợi (chỉ phân tích sợi trên cùng)
Di truyền Mã số
Nhìn thấyhttp://golgi.harvard.edu/biolinks/gencode.html>. Chúng hiện được hỗ trợ:
phổ quát (mặc định)
Euplotes
tứ màng
Candida
Acetabularia
Ty thể-Canonical
Ty thể-Động vật có xương sống
Ty thể-Chân khớp
Ty thể-Động vật da gai
Ty thể-Động vật thân mềm
Ty thể-Ascidians
Ty thể-tuyến trùng
Ti thể-Platyhelminths
Ti thể-men
Ti thể-Euascomycetes
Ty thể-Động vật nguyên sinh
2015-12-28 Bộ chuyển mã.LONGORFS(1)
Sử dụng TransDecoder.LongOrfs trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net
