Đây là ứng dụng Linux có tên GenOO-HTS để chạy trong Linux trực tuyến có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống dưới dạng genoo-code-2013_04_18.tar.gz. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng có tên GenOO-HTS này để chạy trong Linux trực tuyến với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
MÀN HÌNH
Ad
GenOO-HTS để chạy trong Linux trực tuyến
MÔ TẢ
GenOO-HTS [jee-noo] là một mã nguồn mở; khung Perl hướng đối tượng được phát triển đặc biệt để thiết kế các công cụ phân tích giải trình tự thông lượng cao (HTS). Mục đích chính của GenOO-HTS là làm cho các phân tích HTS đơn giản trở nên dễ dàng và các phân tích phức tạp có thể thực hiện được. GenOO-HTS mô hình hóa các thực thể sinh học thành các đối tượng Perl và cung cấp các thuộc tính và phương pháp có liên quan cho phép thao tác với dữ liệu giải trình tự thông lượng cao. Sử dụng GenOO-HTS làm mô-đun phát triển cốt lõi giúp giảm thiểu chi phí và độ phức tạp của việc quản lý dữ liệu và các thực thể sinh học trong tầm tay. GenOO-HTS đã được thiết kế để linh hoạt, dễ dàng mở rộng với cấu trúc mô-đun và các yêu cầu tối thiểu đối với các công cụ và thư viện bên ngoài.Tính năng
- Tổ chức các thực thể sinh học dưới dạng các đối tượng perl (vùng gen, gen, bản sao, intron / exon, v.v.)
- Tổ chức các thực thể trình tự dưới dạng đối tượng / thuộc tính perl (đọc trình tự, căn chỉnh, v.v.)
- Dễ dàng nhập / xuất từ các định dạng tệp được sử dụng rộng rãi (SAM, BED, FASTA, FASTQ)
- Nhất quán và dễ dàng mở rộng
Khán giả
Khoa học / Nghiên cứu, Nhà phát triển
Ngôn ngữ lập trình
Perl
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/genoo/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.
