Đây là ứng dụng Linux có tên là phần mềm GMATA cho điểm đánh dấu Genomic SSR có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống dưới dạng GMATAv2.2.jar. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng này có tên là phần mềm GMATA cho điểm đánh dấu Genomic SSR với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
MÀN HÌNH
Ad
Phần mềm GMATA cho điểm đánh dấu Genomic SSR
MÔ TẢ
Phần mềm GMATA v21 là gì
Ứng dụng phân tích tế bào vi mô toàn bộ gen (GMATA) là một phần mềm để phân tích Trình tự lặp lại đơn giản (SSR), thiết kế và lập bản đồ đánh dấu SSR trong bất kỳ trình tự DNA nào. Nó có các chức năng sau:
1. Khai thác SSR;
2. Phân tích thống kê và vẽ biểu đồ;
3. Xem đồ họa SSR loci;
4. Thiết kế điểm đánh dấu;
5. Bản đồ điện tử và điều tra khả năng chuyển giao điểm đánh dấu.
GMATA chính xác, nhạy và nhanh. Nó được thiết kế để xử lý các bộ dữ liệu trình tự gen lớn, đặc biệt là các trình tự toàn bộ bộ gen lớn. Về lý thuyết, các bộ gen ở bất kỳ kích thước nào đều có thể được GMATA phân tích một cách dễ dàng. Phần mềm GMATA hoạt động trên máy chủ, máy tính để bàn hoặc thậm chí là máy tính xách tay và nó có thể chạy trong giao diện đồ họa chỉ với các cú nhấp chuột hoặc chạy trong dòng lệnh hoặc trong đường dẫn tự động. Nó cũng đa nền tảng và hỗ trợ Unix / Linux, Win và Mac. Kết quả từ phần mềm GMATA có thể được hiển thị trực tiếp bằng đồ thị với bộ gen hoặc các tính năng gen trong Gbrowser và dễ dàng tích hợp với bất kỳ cơ sở dữ liệu bộ gen nào.
Tính năng
- Khai thác SSR chính xác và nhanh nhất trong bất kỳ chuỗi lớn nào
- Hoàn thành phân tích thống kê và lập biểu đồ
- Biểu đồ SSR và đồ họa đánh dấu hiển thị trong Gbrowser với các tính năng bộ gen
- Thiết kế điểm đánh dấu SSR cụ thể và PCR mô phỏng
- Bản đồ điện tử và điều tra khả năng chuyển nhượng điểm đánh dấu
- cũng có sẵn tại https://github.com/XuewenWangUGA/GMATA.git
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/gmata/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.