Đây là ứng dụng Linux có tên GMcloser có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống dưới tên GMcloser-1.6.2.tar.gz. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng có tên GMcloser này với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
GMcloser
Ad
MÔ TẢ
GMcloser lấp đầy và thu hẹp các khoảng trống có trong các cụm giàn giáo, đặc biệt là những khoảng trống được tạo ra bởi tập hợp de novo của toàn bộ bộ gen với các lần đọc trình tự thế hệ tiếp theo (NGS). Không giống như các công cụ thu hẹp khoảng cách khác chỉ sử dụng các lần đọc NGS, GMcloser sử dụng các bộ liên kết lắp sẵn hoặc các bộ đọc dài làm trình tự để thu hẹp khoảng cách và sử dụng các lần đọc kết thúc (PE) được ghép nối và thuật toán dựa trên khả năng để cải thiện độ chính xác và hiệu quả của khoảng cách Khép kín. Hiệu quả của việc thu hẹp khoảng cách có thể được tăng lên bằng cách xử lý liên tiếp với các bộ contig khác nhau.Một gói kèm theo, GMvalue, là một công cụ để xác định các vị trí lắp ráp sai trong khung và giàn giáo. Không giống như các công cụ liên quan khác, GMvalue có thể xác định các danh mục lắp ráp sai với một số tùy chọn và có thể được áp dụng cho các tập hợp của một bộ gen kích thước lớn. Bằng cách sử dụng tùy chọn -e, GMvalue cũng tạo ra các cụm không có lỗi bằng cách tách hoặc sửa các cụm sai.
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/gmcloser/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.
