Đây là ứng dụng Linux có tên Kinannote để chạy trong Linux trực tuyến có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống dưới tên Kinannote_1.0.tar. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng có tên Kinannote này để chạy trong Linux trực tuyến với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
MÀN HÌNH
Ad
Kinannote để chạy trong Linux trực tuyến
MÔ TẢ
Kinannote xác định và phân loại các kinase protein trong tệp fasta do người dùng cung cấp bằng cách sử dụng HMM có nguồn gốc từ các kinase protein serine / threonine, một ma trận cho điểm cụ thể về vị trí bắt nguồn từ HMM và so sánh với phiên bản cục bộ của cơ sở dữ liệu kinase được quản lý từ kinase.com. Nếu người dùng nhập một proteome hoàn chỉnh, các mô-đun bổ sung sẽ đánh giá tính hoàn chỉnh của kinome và đặt nó vào ngữ cảnh với kinome tham chiếu. Kinannote chạy trên dòng lệnh unix và phụ thuộc vào cài đặt local hmmer 2 và Blast 2.24.Trích dẫn Kinannote:
Kinannote, một chương trình máy tính để xác định và phân loại các thành viên của siêu họ protein kinase của sinh vật nhân thực
Jonathan M. Goldberg; Allison Griggs; Janet L. Smith; Brian Haas; Jennifer Wortman; Tiền Đông Tăng
Tin sinh học 2013; doi: 10.1093 / bioinformatics / btt419
http: http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/29/19/2387.full
pdf: http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/29/19/2387.full.pdf+html
Khán giả
Nghiên cứu khoa học
Ngôn ngữ lập trình
Perl
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/kinannote/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.
