Đây là ứng dụng Linux có tên miRDP2 để chạy trong Linux trực tuyến có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống dưới dạng miRDP2-v1.1.4.tar.gz. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng có tên miRDP2 này để chạy trong Linux trực tuyến với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
miRDP2 để chạy trong Linux trực tuyến
Ad
MÔ TẢ
miRDeep-P2 (miRDP2) được phát triển để phân tích chính xác và nhanh chóng các phiên mã microRNA (miRNA) ở thực vật. Nó được áp dụng từ miRDeep-P (miRDP) với các chiến lược mới và thuật toán đại tu. Chúng tôi đã thử nghiệm miRDP2 để phân tích các bản sao miRNA ở những thực vật có kích thước bộ gen tăng dần như Arabidopsis, lúa, cà chua, ngô và lúa mì. So với miRDeep-P và một số công cụ tính toán khác, miRDP2 xử lý dữ liệu NGS với tốc độ vượt trội. Bằng cách kết hợp các tiêu chí chú thích miRNA thực vật mới được cập nhật, độ chính xác của miRDP2 cũng được cải thiện rõ rệt. Kết quả của chúng tôi chứng minh miRDP2 là một công cụ nhanh chóng và chính xác để phân tích bộ phiên mã miRNA ở thực vật.Tham khảo: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bty972
Tính năng
- RNA nhỏ
- microRNA (miRNA)
- Trình tự thế hệ tiếp theo (NGS)
- Perl
Khán giả
Nghiên cứu khoa học
Ngôn ngữ lập trình
Perl
Môi trường cơ sở dữ liệu
Perl DBI / DBD
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/mirdp2/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.