Đây là ứng dụng Linux có tên Pontos để chạy trong Linux trực tuyến có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống là Pontos-3.0.jar. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng có tên Pontos này để chạy trong Linux trực tuyến với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
MÀN HÌNH
Ad
Pontos để chạy trong Linux trực tuyến
MÔ TẢ
Pontos là một chương trình Java đồ họa, dễ sử dụng để tính toán các ma trận khoảng cách (hoặc độ tương tự) chưa được điều chỉnh từ các sắp xếp trình tự DNA ở định dạng PHYLIP. Nó cũng tạo ra sự liên kết "khác biệt" với những căn chỉnh thông thường (và ngược lại).Nó có thể xử lý các lỗ hổng và sự mơ hồ theo nhiều cách khác nhau.
Khoảng cách có thể là:
- tất cả đều được sử dụng;
- tất cả đều bị bỏ qua;
- chỉ bị bỏ qua ở phần cuối của các trình tự, theo cách thức từng cặp;
- chỉ bị bỏ qua ở các phần cuối, nhưng bây giờ trên toàn cầu (thực tế là cắt toàn bộ sự liên kết đến các chuỗi xa nhất từ các phần cuối).
Sự mơ hồ (những thứ như R, Y, N, W, v.v. trong một chuỗi DNA) có thể được xử lý như sau:
- coi những điều không rõ ràng là luôn luôn khác biệt;
- coi sự không rõ ràng là khác một phần (ví dụ: R sẽ khác 0.5 với A hoặc G);
- bỏ qua những điểm mơ hồ trong mỗi phép so sánh từng cặp;
- loại bỏ tất cả các cột, trên toàn cầu, hiển thị bất kỳ sự mơ hồ nào.
Pontos được viết bằng Linux, nhưng nên chạy trong bất kỳ hệ thống nào có Java hoạt động. Pontos được cấp phép theo GPL phiên bản 3.
Khán giả
Khoa học / Nghiên cứu, Người dùng cuối / Máy tính để bàn
Giao diện người dùng
Đu quay Java
Ngôn ngữ lập trình
Java
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/pontos/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.