Đây là ứng dụng Windows có tên là trình phân tích mô típ được phân công Microarray để chạy trong Windows trực tuyến trên Linux trực tuyến có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống dưới dạng MAMA_latest.zip. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng có tên là Microarray Assosiated motif analyzer này để chạy miễn phí trong Windows trực tuyến trên Linux trực tuyến với OnWorks.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động bất kỳ trình giả lập trực tuyến OS OnWorks nào từ trang web này, nhưng trình giả lập trực tuyến Windows tốt hơn.
- 5. Từ Hệ điều hành Windows OnWorks bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng và cài đặt nó.
- 7. Tải xuống Wine từ kho phần mềm phân phối Linux của bạn. Sau khi cài đặt, bạn có thể nhấp đúp vào ứng dụng để chạy chúng với Wine. Bạn cũng có thể thử PlayOnLinux, một giao diện đẹp mắt trên Wine sẽ giúp bạn cài đặt các chương trình và trò chơi phổ biến của Windows.
Wine là một cách để chạy phần mềm Windows trên Linux, nhưng không cần Windows. Wine là một lớp tương thích Windows mã nguồn mở có thể chạy các chương trình Windows trực tiếp trên bất kỳ máy tính để bàn Linux nào. Về cơ bản, Wine đang cố gắng triển khai lại đủ Windows từ đầu để nó có thể chạy tất cả các ứng dụng Windows đó mà không thực sự cần đến Windows.
Bộ phân tích mô típ được hỗ trợ Microarray để chạy trong Windows trực tuyến trên Linux trực tuyến
Ad
MÔ TẢ
Chúng tôi đã phát triển một phương pháp không phân cụm mới, máy phân tích mô típ liên kết với microarray (MAMA), để dự đoán các yếu tố tác động cis mới dựa trên các điểm tương đồng về trình tự có trọng số và cấu hình biểu hiện gen trong phân tích microarray. Mô phỏng biểu hiện gen được thực hiện bằng máy vectơ hỗ trợ và dựa trên sự hiện diện của các mô típ và cặp mô típ được dự đoán. Độ chính xác của biểu hiện gen mô phỏng được sử dụng để đánh giá chất lượng của dự đoán và để tối ưu hóa các tham số được sử dụng trong phương pháp này. Sau khi tối ưu hóa, MAMA đã mô phỏng chính xác hơn 87% biểu hiện gen.Xem Kakei Y, Ogo Y, Itai RN, et al. (2013) Phát triển một phương pháp dự đoán mới về nguyên tố cis để đưa ra giả thuyết về chức năng cộng tác của các cặp nguyên tố cis trong tình trạng thiếu sắt. Cơm 6 (1): 22.
Khán giả
Nghiên cứu khoa học
Giao diện người dùng
Dòng lệnh
Ngôn ngữ lập trình
Python, Perl, C
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/microarray-motif-analyzer/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.
