这是命令 obconformer,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序:
您的姓名
遵守者 — 生成构象坐标
概要
遵守者 # of 构象者 # of 优化 步骤 文件名
商品描述
obconformer 工具可以作为构象研究的一部分,通过生成随机
使用蒙特卡罗搜索的符合者。 一批构象者中最好的构象者
将在执行提供的几何优化步骤数后输出。 默认情况下,
obconformer 使用 MMFF94 力场。
示例
obconformer 250 100 baseconformer.sdf >rotamer1.sdf
生成 baseconformer.sdf 的最佳构象器(250 个中)并将其写入 rotamer1.sdf
经过 100 次几何优化步骤后
使用 onworks.net 服务在线使用 obconformer