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altree-convertp - 云端在线

通过 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行 altree-convertp

这是 altree-convertp 命令,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器

程序:

您的姓名


altree-convert - 标题...

概要


altree-convert [选项]

选项:
--version 程序版本
--short-help|h 简短的帮助信息
--help 带有选项说明的帮助消息
--man 完整文档
--first-input-file|i 输入文件 1
--second-input-file|j 输入文件2(非强制)
--output-file|o 输出文件
--case-control-output|c 输出包含 nb 个案例/控制
--数据类型|t DNA|NUM
--phylo-prog|p PAUP|PHYLIP
--reconstruct-prog|r 阶段|FAMHAP
--data-quali|q 数据类型:定性或定量
--nbind-threshold|s 保持单倍型所需的最小个体数

配置


- 版
打印程序版本并退出。

--简短的帮助
打印简短的帮助消息并退出。

- 帮帮我 打印带有选项说明和退出的帮助消息。

- 男人 打印手册页并退出。

--第一个输入文件|i
输入文件 1(单倍型重建程序的输出)

--第二个输入文件|j
输入文件 2(famhap 的第二个输出或包含疾病状态的文件)

--输出文件|o
输出文件

--case-control-输出|c
包含携带每个单倍型的病例数和对照的输出文件

--数据类型|t “DNA”|“SNP”
数据类型:DNA (ATGCU) 或 SNP (0-1)

--phylo-prog|p “菲利普”|“paup”
系统发育重建计划

重建程序|r “家庭|阶段”
单体型重建计划

数据质量|q “定性|定量”
分析的数据类型

nbind-阈值|s
最少数量的携带单倍型的个体需要保留它
进一步分析。 如果要保留所有单倍型,则必须将 0 影响到此
变量

商品描述


本篇 程序 将读取给定的输入文件并为
系统发育重建软件 paup 或 phylip/paml

使用 onworks.net 服务在线使用 altree-convertp


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