这是命令自动配体，可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行，例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序：
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AutoLigand： - 识别受体的配体结合位点
概要
建议通过 autodocktools 提供的 GUI 启动 AutoLigand。
自配体 r FileBaseName -p #_of_pts 以上是为
Debian 软件包。 常规命令行调用是通过python
/usr/share/pyshared/AutoDockTools/AutoLigand.py -r 文件库名称 -p #_of_pts
商品描述
自配体 是 Python 脚本 AutoLigand.py 的符号链接。 这执行一个
自动调查蛋白质特定部分结合的可能性
配体。
命令说明...
-r FileBaseName = 只是受体图文件的名称部分（即 FileBaseName.C.map）
-p #_of_pts = 要使用的填充点数 (int)
注：可省略 -a 使用的选项。
可选参数：
[-a #] = 配体的重原子数（#_of_pts 将设置为 6x 个原子）[-x #
-y # -z #] = 可选的 x,y,z 坐标开始填充（浮动）
当输入起点时，只会运行一次填充
[-一世 ＃ -j # -k #] = 第二个点的可选 x,y,z 坐标（浮动）
当输入第二个点时，填充将连接两个点 注意：连接
路径尚未优化 - 谨慎使用
[-f #] = 要生成的填充数 - 默认为 10 [-e] = 使用额外的原子
NA、N、SA 和 A 型
注意：这些结果可能有问题 - 谨慎使用
[-m] = 制作输出填充进度的影片
使用 onworks.net 服务在线使用自动配体
