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bowtie2-inspect - 云端在线

通过 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行 bowtie2-inspect

这是命令 bowtie2-inspect,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器

程序:

您的姓名


bowtie2-inspect - bowtie2-inspect-* 索引的包装器

概要


bowtie2-检查 [选项]*

商品描述


本·朗米德 (Ben Langmead) 的 Bowtie 2 版本 2.2.6 ([电子邮件保护],www.cs.jhu.edu/~langmea)


bt2 文件名减去尾随 .1.bt2/.2.bt2

默认情况下,将索引核苷酸序列的 FASTA 记录打印为标准
出去。 和 -n, 只打印名称。 和 -s, 只打印索引的摘要
参数和序列。 和 -e, 保留颜色(如果适用)。

配置


--大索引
强制检查“大”索引,即使存在“小”索引。

-a/ - 穿过
FASTA 输出中的字符数(默认值:60)

-n/--名称
仅打印参考序列名称

-s/ - 概括
打印摘要包括ref 名称、长度、索引属性

-e/--bt2-ref
从 .bt2 重建参考(慢,保留颜色)

-v/--详细
详细输出(用于调试)

-h/ - 帮助
打印工具及其选项的详细说明

- 帮帮我 打印此使用消息

使用 onworks.net 服务在线使用 bowtie2-inspect


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