这是 bp_multi_hmmsearch.plp 命令,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序:
您的姓名
multi_hmmsearch - 使用对多个 FASTA 文件执行 hmmsearch
一个索引文件
概要
multi_hmmsearch -p hmm_file [-i] -f 索引文件
商品描述
技术上不是 Bio::Tools::Run 脚本,因为它不使用任何 Bioperl 或 Bioperl-run
组件,但它很有用。
强制性 选项:
-p HMM 配置文件用于搜索。
-f INDEX 文件,其中包含多个 FASTA 文件的列表
搜索。
Special 选项:
-i 使用生成的 hmms 文件创建一个新的索引文件。 这是
如果您想将此列表作为输入参数传递给
另一个程序。
-h 显示此文档。
信息反馈
邮件 书单
用户反馈是该模块和其他 Bioperl 模块演变过程中不可或缺的一部分。 发送
您的意见和建议最好发送到 Bioperl 邮件列表。 您的参与
非常感谢。
[电子邮件保护] - 一般讨论;一般交流
http://bioperl.org/wiki/Mailing_lists - 关于邮件列表
报告 错误
向 Bioperl 错误跟踪系统报告错误,以帮助我们跟踪错误及其
解析度。 错误报告可以通过网络提交:
http://redmine.open-bio.org/projects/bioperl/
使用 onworks.net 服务在线使用 bp_multi_hmmsearch.plp