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cmtk-glm - 云端在线

通过 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行 cmtk-glm

这是命令 cmtk-glm 可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器

程序:

您的姓名


glm - 一般线性模型

概要


glm [选项] ctlfile imgfile_pattern [ctlfile imgfile_pattern ...]

商品描述


使用一般线性模型对多幅图像中的像素强度进行统计建模。

模型的自变量在多个控制文件之一中定义。 每个
控制文件是一个文本文件,每个自变量有一个空格分隔的列。

控制文件的第一行定义了变量名,即标签
识别每个变量。 以下每一行包含每个独立变量的一个值。

示例:

身份证年龄性别
01 20 0
02 30 1

每个控制文件名后跟一个文件名模式。 在该模式中,单个“%s”
占位符由在每个控制文件行的第一列中找到的值替换。
结果字符串是读取的图像的路径并与模型变量相关联
列在该特定控制文件行上。

使用上面的控制文件示例,模式 'images/subject%s.nii' 将扩展为
图像文件名为“images/subject01.nii”和“images/subject02.nii”。

可以使用多个控制文件,每个文件具有不同的图像文件模式。

配置


全球 工具包 附加选项 (这些 ,那恭喜你, 共用的, by 所有 CMTK 工具)
- 帮帮我
将基本命令行选项列表写入标准输出。

--全部帮助
将基本和高级命令行选项的完整列表写入标准输出。

--维基
将命令行选项列表写入 MediaWiki 标记中的标准输出。

- 男人
将“nroff”标记中的手册页源代码写入标准输出。

- 版
将工具包版本写入标准输出。

- 回声
将当前命令行写入标准输出。

--详细级别
设置详细级别。

--详细, -v
将详细级别增加 1(已弃用;支持向后兼容)。

--线程
设置最大并行线程数(对于 POSIX 线程和 OpenMP)。

输入 个人设置
- 庄稼 , -c
为了节省空间/时间,裁剪图像:x0,y0,z0,x1,y1,z2

型号 个人设置
--规范化, -n
标准化模型参数wrt数据方差。

--exp, -e
使用指数模型而不是线性模型。

选择 of 独立 (Independent) 变量
--排除-常量, -x
从模型中排除自动常数参数。

--忽略参数 , -i
忽略给定 NUMBER (0..n-1) 的参数。 可以重复。

--选择参数 , -s
为模型选择具有给定 NAME 的参数。 可以重复。

输出 个人设置
--输出模式 , -O
输出的文件名模式。

%s 替换为图像类型('fstat'、'tstat' 或 'param')
%d 替换为自变量编号(整个模型为 0)
%s 替换为自变量名称(整个模型的“模型”)

[默认: 模型_%s_%02d_%s.nii ]

作者


Torsten Rohlfing,Michael P. Hasak、Greg Jefferis、Calvin R.
Maurer、Daniel B. Russakoff 和 Yaroslav Halchenko

使用 onworks.net 服务在线使用 cmtk-glm


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