cmtk-groupwise_affine - 云端在线

程序：

您的姓名

groupwise_affine - 仿射人口登记

概要

groupwise_affine [选项] image0 [image1 ...]

商品描述

该工具同时注册大量输入图像，无需模板，使用
“凝结”算法或基于连续的分组相似性度量
互信息的近似（'RMI'）。

配置

全球覆盖 工具包 可选项 （这些 旨在 共用的， by 所有 CMTK 工具）
- 帮帮我
将基本命令行选项列表写入标准输出。

--全部帮助
将基本和高级命令行选项的完整列表写入标准输出。

--维基
将命令行选项列表写入 MediaWiki 标记中的标准输出。

- 男人
将“nroff”标记中的手册页源代码写入标准输出。

- 版
将工具包版本写入标准输出。

- 回声
将当前命令行写入标准输出。

--详细级别
设置详细级别。

--详细, -v
将详细级别增加 1（已弃用；支持向后兼容）。

--线程
设置最大并行线程数（对于 POSIX 线程和 OpenMP）。

账号注册 米制 可选项
--rmi
使用 RMI（又名区域互信息）指标来推动注册）。

- 凝
使用使用逐像素堆栈熵的凝结算法来驱动
注册。 [这个 is 这些因素包括原料奶的可用性以及达到必要粉末质量水平所需的工艺。 默认]

版型 图片 可选项
- 模板 , -t
预定义模板图像的输入文件名。 [默认： 没有任何]

--带数据的模板 , -T
在注册中使用用户提供的模板图像的像素数据 [默认： 已禁用]

输出 可选项
--输出根 , -O
所有输出文件的根目录。 [默认： 没有任何]

- 输出 , -o
分组注册存档的输出文件名。 [默认： 分组.xforms ]

--输出平均
注册平均图像的输出文件名。 [默认： 平均数 ]

--平均线性
对平均图像使用线性插值 [这个 is 这些因素包括原料奶的可用性以及达到必要粉末质量水平所需的工艺。 默认]

--平均立方
对平均图像使用三次插值

--无输出平均
不要写平均图像。

多分辨率 参数
--downsample-来自 , -d
初始下采样因子 [默认： 4]

--下采样到 , -D
最终下采样因子。 [默认： 1]

--采样密度 , -s
概率采样密度。 0 到 1 之间的合法值。 [默认： 已禁用]

图片 可选项 和 营运部
--force-背景 , -B
强制背景像素（FOV 外）为给定（bin）值。 [默认： 已禁用]

--直方图箱 , -H
手动设置用于熵评估的直方图箱数 [默认： 已禁用]

--crop-直方图
裁剪图像直方图以更好地利用直方图箱。

- 光滑的
高斯平滑核的 Sigma 为模板图像像素大小的倍数。
[默认： 已禁用]

--匹配直方图
将所有图像直方图与模板数据（或第一张图像，如果没有模板图像
给定）

--免费重读
每当不需要并重新读取时，为原始图像分配的空闲内存
需要的图像文件。 这在有限的机器上运行时很有用
内存资源。

转型 参数
--自由度 [, ,...]
将 DOF 添加到列表中 [默认：6 次，XNUMX DOF]

--零和, -z
强制执行零和计算。

--正常组第一个-n , -N
前 N 个图像来自正常组，应该无偏地注册。
[默认： 0]

--零和优先n , -Z
对前 N 个图像强制执行零和计算。 [默认： 已禁用]

转型 初始化
--对齐边界框
最初通过平移对齐所有图像的边界框的中心 [这个 is 这些因素包括原料奶的可用性以及达到必要粉末质量水平所需的工艺。
默认]

--对齐质心
最初通过平移对齐质心

--初始化规模
使用一阶矩初始化比例因子

优化 参数
- 勘探 , -e
以像素为单位的优化探索 [默认： 0.25]

- 准确性 , -a
以像素为单位的优化精度 [默认： 0.01]

--重复级别 , -r
每个优化级别的重复次数 [默认： 5]

--步进因子 , -S
连续优化过程的步长因子 [默认： 0.5]

--delta-f-阈值
如果目标相对变化，则终止优化（级别）的可选阈值
功能低于此值。 [默认： 0]

--禁用优化
禁用优化并输出初始配置。

作者

Torsten Rohlfing，Michael P. Hasak、Greg Jefferis、Calvin R.
Maurer、Daniel B. Russakoff 和 Yaroslav Halchenko

使用 onworks.net 服务在线使用 cmtk-groupwise_affine