这是命令 cmtk-groupwise_warp 可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行，例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序：
您的姓名
groupwise_warp - 非刚性人口登记
概要
groupwise_warp [选项] affineGroupRegistration
商品描述
该工具非刚性地同时注册一组输入图像，无需
模板，使用“凝结”算法或基于分组的相似性度量
关于互信息（'RMI'）的连续近似。
配置
全球覆盖 工具包 可选项 （这些 旨在 共用的， by 所有 CMTK 工具）
- 帮帮我
将基本命令行选项列表写入标准输出。
--全部帮助
将基本和高级命令行选项的完整列表写入标准输出。
--维基
将命令行选项列表写入 MediaWiki 标记中的标准输出。
- 男人
将“nroff”标记中的手册页源代码写入标准输出。
- 版
将工具包版本写入标准输出。
- 回声
将当前命令行写入标准输出。
--详细级别
设置详细级别。
--详细, -v
将详细级别增加 1（已弃用；支持向后兼容）。
--线程
设置最大并行线程数（对于 POSIX 线程和 OpenMP）。
账号注册 米制 可选项
--rmi
使用 RMI（又名区域互信息）指标来推动注册）。
- 凝
使用使用逐像素堆栈熵的凝结算法来驱动
注册。 [这个 is 这些因素包括原料奶的可用性以及达到必要粉末质量水平所需的工艺。 默认]
版型 图片 可选项
- 模板 , -t
使用给定文件覆盖模板图像。 [默认： 没有任何]
--带数据的模板 , -T
在注册中使用用户提供的模板图像的像素数据 [默认： 已禁用]
多分辨率 参数
--downsample-来自 , -d
初始下采样因子 [4]。 [默认： 4]
--下采样到 , -D
最终下采样因子 [1]。 [默认： 1]
--采样密度 , -s
概率采样密度 [默认：关闭]。 [默认： -一]
输出 可选项
--输出根 , -O
所有输出文件的根目录。 [默认： 没有任何]
- 输出 , -o
分组注册存档的输出文件名。 [默认： 分组.xforms ]
--输出平均
注册平均图像的输出文件名。 [默认： 平均数 ]
--无输出平均
不要写平均图像。
--平均立方
对平均图像使用三次插值（默认：线性）
图片 可选项 和 营运部
--force-背景 , -B
强制背景像素（FOV 外）为给定（bin）值。 [默认： 已禁用]
--直方图箱 , -H
设置用于熵评估的直方图箱数。 [默认： 已禁用]
--crop-直方图
裁剪图像直方图以更好地利用直方图箱。
--匹配直方图
将所有图像直方图与模板数据（或第一张图像，如果没有模板图像
给定）
--重复匹配直方图
频繁重复基于直方图的强度匹配以考虑不断变化的音量
比例。
--平滑像素
模板图像像素大小倍数的高斯平滑核的Sigma
[默认： 已禁用]
--平滑-cps
控制点 delta 倍数的高斯平滑核的 Sigma [默认：
已禁用]
转型 参数
--网格间距
控制点网格间距。 [默认： 40]
--网格间距适合
使用适合体积 FOV 的网格间距
--细化网格 , -r
细化转换网格的次数 [默认值：0]。 [默认： 0]
转型 约束 可选项
--零和, -z
强制执行零和计算。
--零和无仿射
强制执行零和计算排除仿射组件。
--正常组第一个-n , -N
前 N 个图像来自正常组，应该无偏地注册。
[默认： 0]
--零和优先n , -Z
对前 N 个图像强制执行零和计算。 [默认： 已禁用]
--雅可比重量 , -J
雅可比体积保留约束的权重 [默认：关闭] [默认： 0]
--弯曲能量重量 , -E
网格弯曲能量正则化约束的权重 [默认：关闭] [默认： 0]
优化 参数
- 勘探 , -e
以像素为单位的优化探索 [默认： 0.25]
- 准确性 , -a
以像素为单位的优化精度 [默认： 0.01]
--步进因子 , -S
连续优化过程的步长因子 [默认： 0.5]
--delta-f-阈值
如果目标相对变化，则终止优化（级别）的可选阈值
功能低于此值。 [默认： 0]
--部分梯度阈值 , -p
部分梯度归零的阈值因子 [<0 关闭] [默认： 0]
--激活-无信息
激活潜在的无信息控制点
--disable-cp-掩码
遮罩图像（匹配模板网格）的路径定义控制点的区域
应该禁用。 这保证了蒙版前景区域保持不变形。
[默认： 没有任何]
--禁用优化
禁用优化并输出初始配置。
作者
Torsten Rohlfing，Michael P. Hasak、Greg Jefferis、Calvin R.
Maurer、Daniel B. Russakoff 和 Yaroslav Halchenko
使用 onworks.net 服务在线使用 cmtk-groupwise_warp
