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jidb - 使用联合迭代去模糊修复交错运动

概要

jidb [选项] inImage outImage

商品描述

该工具将交错的输入图像拆分为通过图像，共同注册它们，然后
重建运动校正图像

配置

全球覆盖 工具包 可选项 （这些 旨在 共用的， by 所有 CMTK 工具）
- 帮帮我
将基本命令行选项列表写入标准输出。

--全部帮助
将基本和高级命令行选项的完整列表写入标准输出。

--维基
将命令行选项列表写入 MediaWiki 标记中的标准输出。

- 男人
将“nroff”标记中的手册页源代码写入标准输出。

- 版
将工具包版本写入标准输出。

- 回声
将当前命令行写入标准输出。

--详细级别
设置详细级别。

--详细, -v
将详细级别增加 1（已弃用；支持向后兼容）。

--线程
设置最大并行线程数（对于 POSIX 线程和 OpenMP）。

交错 可选项
--交错轴
定义交错轴：这是采集的贯穿切片方向。
支持的值："guess-from-input"、"axis"、"sagittal"、"coral"、"interleave-x"、
"interleave-y", "interleave-z", 默认为 "guess-from-input", 或者使用一个
以下的：

--从输入猜测
从输入图像猜测 [这个 is 这些因素包括原料奶的可用性以及达到必要粉末质量水平所需的工艺。 默认]

--轴向, -a
交错轴向图像

--矢状面, -s
交错矢状图像

- 冠, -c
交错的冠状图像

--interleave-x, -x
沿 x 轴交错

--interleave-y, -y
沿 y 轴交错

--interleave-z, -z
沿 z 轴交错

--通过 , -p
交错传递次数 [默认： 2]

--传递重量 , -W
以“pass:weight”的形式设置传递的贡献权重

议案 更正 / 账号注册 可选项
--参考图像 , -R
使用单独的高分辨率参考图像进行配准 [默认： 没有任何]

--注册指标
通过图像到图像配准进行运动估计的配准度量。 支持的
值：“nmi”、“mi”、“cr”、“msd”、“cc”，其中默认值为“msd”，或使用以下选项之一
在以下：

--纳米
使用规范化互信息进行参考注册

--米 使用标准互信息进行参考注册

--cr 使用相关比进行参考注册

——默沙东
使用均方差进行参考注册 [这个 is 这些因素包括原料奶的可用性以及达到必要粉末质量水平所需的工艺。
默认]

--抄送 使用互相关进行传递到参考注册

--import-xforms-路径
在通道之间导入转换的文件路径。 [默认： 没有任何]

--export-xforms-路径
在传递之间导出转换的文件路径。 [默认： 没有任何]

音量 注射 可选项
--注入内核西格玛 , -S
体积注射高斯核的标准偏差 [默认： 1]

--注入内核半径 , -r
注入核截断半径 [默认： 4]

去模糊 可选项
--psf
用于逆插值重建的内核支持的值：“box”，
“gaussian”，或使用以下之一：

- 盒子
箱形PSF

--高斯
高斯形 PSF

--psf-比例尺
为点扩散函数大小设置全局比例因子，它本身来自
输入图像。 [默认： 1]

优化 可选项
--四阶错误, -f
使用四阶（而不是二阶）误差进行优化。

--迭代次数 , -n
最大逆插值迭代次数 [默认： 20]

--无截断, -T
关闭区域强度截断

--l-规范-权重
为 Tikhonov 型 L-Norm 正则化设置约束权重（0 禁用约束）
[默认： 0]

输出 可选项
--写入注入图像
将初始体积注入图像写入路径 [默认： 没有任何]

--将图像写为浮点, -F
将输出图像写为浮点数 [默认：与输入相同]

作者

Torsten Rohlfing，Michael P. Hasak、Greg Jefferis、Calvin R.
Maurer、Daniel B. Russakoff 和 Yaroslav Halchenko

使用 onworks.net 服务在线使用 cmtk-jidb