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戈德 - 并行计算图的稀疏矩阵排序
概要
戈德 [选项[文件[进攻[文件]
商品描述
戈德 程序以并行方式计算 Scotch 源图的排序
表示一些对称稀疏矩阵的模式。
源图文件 文件 要么是一个集中的图形文件,要么是一组代表
分布式图的片段。 结果排序存储在文件中 进攻. 最终
日志信息(例如选项产生的信息 -v) 发送到文件 文件。 何时
未指定文件名,数据从标准输入读取并写入标准
输出。 标准流也可以用破折号“-”明确表示。
在编译时包含适当的库后, 戈德 可以直接处理
压缩图,作为输入和输出。 无论何时,流都被视为已压缩
它的名称后缀有压缩文件扩展名,例如“brol.grf.bz2”或
'-.gz'。 可以支持的压缩格式是 bzip2 格式 ('.bz2'),
gzip 格式('.gz')和 lzma 格式('.lzma',仅用于输入)。
戈德 基于 MPI 接口的实现来在整个处理过程中传播工作
元素。 因此它不太可能直接运行,而是通过一些启动器
命令如 米匹伦.
配置
-科普特 根据一项或多项选择默认排序策略 选项 之中:
b 尽可能执行负载平衡。
q 优先质量高于速度(默认)。
s 速度优于质量。
t 加强安全。
x 加强可扩展性。
-h 显示一些帮助。
-m文件
将列块映射数据保存到文件 文件. 映射数据指定,对于每个
顶点,该顶点所属的列块的索引。
-oSTRAT
使用并行图排序策略 STRAT (有关更多信息,请参阅 PT-Scotch 用户手册
信息)。
-r普努姆 为集中文件设置根进程(默认为 0)。
-t文件
将分区树数据保存到文件 文件. 分区树数据指定,对于
每个顶点,该块的父块的第一个顶点的索引
顶点属于哪个。 连同文件中提供的映射数据 文件,
它允许重建嵌套解剖过程的分隔符树。
-V 显示程序版本和版权。
-v动词 将详细模式设置为 动词. 它是一组多个字符中的一个,可以是:
s 策略信息。
t 时间信息。
示例
运行 戈德 在 5 个处理元素上重新排序矩阵图 brol.grf 并保存结果
排序到文件 brol.ord,使用默认的顺序图排序策略:
$ mpirun -np 5 dgord brol.grf brol.ord
运行 戈德 在 5 个处理元素上重新排序存储在图形上的分布式矩阵
片段文件brol5-0.dgr到brol5-4.dgr,并将结果排序保存到文件
brol.ord(见 dgscat(1) 用于解释名称中的 '%p' 和 '%r' 序列
分布式图片段)。
$ mpirun -np 5 dgord brol%p-%r.dgr brol.ord
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