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fastq-join - 云端在线

通过 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行 fastq-join

这是命令 fastq-join,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器

程序:

您的姓名


fastq-join - ea-utils:在重叠的末端连接两个双端读取

概要


快速加入 [选项] [伙伴.fq] -o

商品描述


fastq-join:无效选项 -- 'h' 未知选项 `-h'。

在重叠末端连接两个配对末端读数。

配置


-o FIL 请参阅下面的“输出” -v C 验证 2 个文件探测器 ID 是否匹配
字符 C

使用“ ”(空格)进行 Illumina 读取

-p N N-百分比最大差异 (8) -m N N-最小重叠 (6) -r FIL
详细的针迹长度报告 -R 无反补 -x 允许插入
读取长度

输出:

你可以提供 3 -o 参数,用于 un1、un2、连接文件或一个

参数作为文件名模板。 后缀“un1, un2, or join”被附加到文件中,
或者它们替换 % 字符(如果存在)。

如果存在“伴侣”输入文件(读取条形码),则文件

'un3' 和 'join2' 也被创建。

使用 onworks.net 服务在线使用 fastq-join


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