这是命令 gap5，可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行，例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序：
您的姓名
gap5 - 基因组组装程序（staden 包的一部分）
概要
gap5 [-ro[-maxseq [-maxdb [-skip_notes[DATABASE_NAME.V]
商品描述
Gap5 是一个基因组组装程序。 该程序包含所有工具
期望从装配程序加上许多独特的功能和一个非常容易使用的
界面。 原始版本在 Bonfield,JK、Smith,KF 和 Staden,R 中有描述。 一种
新的 DNA 序列组装程序。 核酸研究。 24, 4992-4999 (1995)
Gap5 非常强大。 每个人都使用一个选项的子集，并有自己的选择
最喜欢的访问和使用方式。 虽然有很多，但用户是
鼓励浏览整个文档一次，只是为了发现什么是
可能，以及最适合自己工作的方式。 至少，这一切
应该阅读介绍性章节，因为从长远来看，它会节省时间。
配置
-ro 只读
-maxseq N
初始最大总共识长度
-maxdb N
初始最大重叠群数 + 读数
-（否_）检查
（不要）在数据库打开时运行检查数据库
-（no_）exec_notes
（不要）在数据库打开时执行 OPEN/CLOS 注释
-(no_)rawdata_note
（不要）使用 RAWD 注释而不是 RAWDATA env。 多变的
-(no_)csel
（不要）在 db open 时启动 contig 选择器
-显示
要使用的 X 显示
-位大小 N
指定新数据库的辅助文件位大小 (32/64)
-同步 显示服务器使用同步模式（调试）
-- 参数列表结束
使用 onworks.net 服务在线使用 gap5
