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gdcm2vtk - 云端在线

通过 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行 gdcm2vtk

这是 gdcm2vtk 命令,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器

程序:

您的姓名


gdcm2vtk - 将 VTK 支持的文件转换为 DICOM。

概要


gdcm2vtk [选项] 文件输入文件输出

商品描述


GDCM2VTK 将 VTK 支持的任何文件(包括 DICOM 文件)作为输入,并将
生成 DICOM 文件作为输出。

有无库存


file-in 输入文件名(支持 DICOM 或 VTK)

文件输出文件名(支持 DICOM 或 VTK)

配置


具体的 选项
--force-rescale 强制缩放。
--force-spacing 力间距。
--palette-color 支持时生成 PALETTE COLOR 文件。
--argb 支持时生成 ARGB 文件。
--compress 支持时生成压缩文件。
--use-vtkdicom 使用 vtkDICOMImageReader(而不是 GDCM)。
--modality 设置模态。
--lower-left 设置左下角。
--shift 设置移位。
--scale 设置比例。
--compress 设置压缩(MetaIO)。
-T --study-uid 研究 UID。
-S --series-uid 系列 UID。
--root-uid 根 UID。

压片 选项
-J --jpeg 以 jpeg 格式压缩图像。
-K --j2k 在 j2k 中压缩图像。
-L --jpegls 在 jpeg-ls 中压缩图像。
-R --rle 在 rle 中压缩图像(仅限无损)。

一般 选项
-h --帮助
打印此帮助文本并退出

-v --版本
打印版本信息并退出

-V --详细
详细模式(警告+错误)。

-W --警告
警告模式,打印警告信息

-E --错误
错误模式,打印错误信息

-D --调试
调试模式,打印调试信息

环境 变量
GDCM_ROOT_UID 根 UID

商品描述


将 VTK 支持的文件转换为 DICOM。

典型用法是:

$ gdcm2vtk 输入文件 output.dcm

它使用 VTK 的内部工厂机制来识别文件(CanRead 函数)。 看
VTK 支持的文件在这里:

VTK可以读写哪些图像文件格式? http://www.vtk.org/Wiki/VTK_FAQ#What_image_file_formats_can_VTK_read_and_write.3F

如果您的输入文件有 4 个组件,则第 4 个组合 (alpha) 将从输出中删除
文件,因为 DICOM 不再支持 alpha 组件(请参阅 –argb 选项)。

特别注意以下文件格式:

1.DICOM:方向余弦和vtkMedicalImageInformation传递到输出
2. BMP:文件可以用查找表保存(见--palette-color)
3. GE Signa: vtkMedicalImageProperties 传递给输出
4. MINC:方向余弦传递到输出
5. TIFF:vtkTIFFReader 目前在 VTK 中状态不佳(VTK 5.2 和 git/master 中的行为不同)。 仅当您知道自己在做什么时才使用它。

CONVERT 元图像 (高清, 嗯)
$ gdcm2vtk 输入文件 output.mha

此命令会将输入 DICOM 文件:inputfile 转换为 MetaImage .mha 文件。 相同的
适用于 .mhd 文件。

CONVERT 心肌梗死/心肌梗死
$ gdcm2vtk 输入文件 output.mha

or

$ gdcm2vtk 输入文件 output.mhd

此命令会将输入的 DICOM 文件: inputfile 转换为 MetaImageData .mha/.mhd
文件中。

CONVERT VTI
$ gdcm2vtk 输入文件 output.vti

此命令会将输入的 DICOM 文件: inputfile 转换为 XML VTK ImageData .vti
文件中。

CONVERT VTK
$ gdcm2vtk 输入文件 output.vtk

此命令会将输入的 DICOM 文件: inputfile 转换为旧的 VTK Structured
点集 .vtk 文件。

CONVERT DICOM


$ gdcm2vtk 输入.dcm 输出.dcm

vtkGDCMImageReader 将用于读取 DICOM 文件,而不是默认值
vtkDICOMImageReader。 请参阅选项 –use-vtkdicom 以使用 vtkDICOMImageReader。

往返 DICOM TO MHD TO DICOM


$ gdcm2vtk input_ybr.dcm 输出.mhd
$ gdcm2vtk --modality US --imageformat 7 输出.mhd 输出.dcm

上面的参考部分显示了如何使用光度学解释来转换 DICOM
YBR_FULL(甚至 YBR_FULL_422 是有损的)转换为另一种文件格式:MetaImage (mhd)。 自从
此文件格式不处理颜色空间,我们必须使用
–imageformat 命令行选项。 此处需要 –modality 命令行选项
情况,因为默认的二级捕获图像存储类系列不允许 YBR
光度学解释。

GDCM2VTK 附注


重要提示:内部 VTK 结构将从输入 DICOM 填充,然后
传递给输出 DICOM 编写器。 转换过程中可能会丢失一些信息
DICOM 到 VTK 到 DICOM。 此选项主要用于测试
vtkGDCMImageReader/vtkGDCMImageWriter 组合。

重要提示:从 JPEG 等有损格式转换时,
损失很重要。 输出 DICOM 将包含所需的有损图像
压缩属性,指示图像沿某处进行了有损压缩
管道。 另请参见 gdcmimg(更好地处理 JPEG)。

重要说明:使用 –use-vtkdicom 时,输出 DICOM 文件将始终写为
MR 图像存储,因为此信息无法从阅读器本身获得。 这允许
正确设置图像方向(患者)。

使用 onworks.net 服务在线使用 gdcm2vtk


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