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gmx-eneconv - 转换能量文件

概要

gmx eneconv [-f [<.edr> [...][-o [<.edr>][-b [-e ]
[-dt [-抵消 [-[没有]设定时间[-[不]排序]
[-[无]rmdh[-scalefac [-[无]错误]

商品描述

多 档 指定为 -f 选项​​：

按排序顺序连接多个能量文件。 在双重时间框架的情况下，
使用后一个文件中的一个。 通过指定 -设置时间 你会被问到开始时间
每个文件。 输入文件取自命令行，因此命令 GMX
enconv -f *.edr -o 固定文件 应该可以。

一种 文件 指定用于 -f:

读取一个能量文件并写入另一个，应用 -dt, -抵消, -t0 和 -设置时间
选项并在必要时转换为不同的格式（由文件扩展名指示）。

-设置时间 先应用，然后 -dt/-抵消 其次是 -b 和 -e 选择哪些帧
来写。

配置

指定输入文件的选项：

-f [<.edr> [...] (能源.edr)
能源档案

指定输出文件的选项：

-o [<.edr>] （固定.edr）
能源档案

其他选项：

-b （-1）
第一次使用

-e （-1）
最后一次使用

-dt (0)
仅当 t MOD dt = offset 时写出帧

-抵消 (0)
时间偏移为 -dt 选项

-[没有]设定时间 （否）
交互式更改开始时间

-[不]排序 （是）
排序能量文件（不是帧）

-[无]rmdh （否）
移除自由能块数据

-scalefac (1)
将能量分量乘以这个因子

-[无]错误 （是）
停止文件中的错误

知 问题

· 合并轨迹时，不更新 sigma 和 E^2（统计所必需的）
正确。 只有实际能量才是正确的。 因此必须计算统计量
其它的办法。

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