这是 gt-speck 命令，可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行，例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序：
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gt-speck - 检查 GFF3 输入中的规范定义合规性。
概要
gt 斑点 [选项] [GFF3_file ...]
商品描述
-规范文件 [文件名]
具有规范定义的文件（默认值：未定义）
-有色 [是|否]
显示彩色输出（默认：是）
-提供索引 [是|否]
在 specfile 命名空间中提供特征索引（n 个输入需要 O(n) 内存
功能）（默认值：否）
-种类 [是|否]
检查前对输入进行排序（n 个输入特征需要 O(n) 内存）（默认值：否）
-失败者 [是|否]
停止处理并报告运行时错误，而不是将它们记录在结果中
（默认：否）
-输出 [绳子]
输出格式选择：json、text、html、statsonly（默认：text）
-类型检查 [绳子]
使用 OBO 文件中给出的本体来验证父子关系。 如果不
给出参数，则使用 gtdata/obo_files 目录中的 SOFA.obo 文件。 如果
给出一个参数，它用作 OBO 文件名。 在这样的文件的情况下
不存在 .奥博 被添加到参数并从
gtdata/obo_files 目录被尝试。 （默认：所以）
-seq文件 [文件名]
设置从中获取序列的序列文件（默认值：未定义）
-encseq [文件名]
设置从中获取序列的编码序列索引名（默认值：
不明确的）
-seq文件
设置从中提取特征使用的序列文件 -- 终止列表
序列文件
-matchdesc [是|否]
从输入文件的序列描述中搜索所需的序列 ID（在
GFF3)，报告第一场比赛（默认：无）
-matchdesc开始 [是|否]
与所需序列的输入文件中的序列描述完全匹配
从开头到第一个空格的 ID（在 GFF3 中）（默认值：无）
-usedesc [是|否]
使用序列描述将序列 ID（在 GFF3 中）映射到实际序列
条目。 如果描述包含序列范围（例如，III:1000001..2000000），则
第一部分用作序列 ID (III) 和第一个范围位置作为偏移量
(1000001)（默认值：否）
-区域映射 [绳子]
将包含序列区域的文件设置为序列文件映射（默认值：未定义）
-o [文件名]
将输出重定向到指定文件（默认值：未定义）
-gzip [是|否]
写入 gzip 压缩输出文件（默认：无）
-bzip2 [是|否]
写入 bzip2 压缩输出文件（默认：无）
-力 [是|否]
强制写入输出文件（默认值：否）
-v [是|否]
详细（默认：否）
-救命
显示帮助并退出
-版
显示版本信息并退出
REPORTING BUGS
将错误报告给[电子邮件保护]>.
使用 onworks.net 服务在线使用 gt-speck
