这是命令 hmm2fetch 可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序:
您的姓名
hmm2fetch - 从 HMM 数据库中检索 HMM
概要
嗯2fetch [选项] 数据库 姓名
商品描述
嗯2fetch 是一个检索 HMM 的小实用程序,称为 姓名 来自 HMMER 模型数据库
被称为 数据库。 以新格式,并将该模型打印到标准输出。 例如,
嗯2fetch PFAM RRM 从 Pfam 中检索 RRM(RNA 识别基序)模型,如果
环境变量 HMMERDB 设置为 Pfam 数据库的位置。 检索到的
HMM 文件以 HMMER 2 ASCII 格式编写。
数据库必须具有关联的 GSI 索引文件。 要索引 HMM 数据库,请使用
程序 嗯2索引。
配置
-h 打印简要帮助; 包括版本号和所有选项的摘要,包括
专家选项。
-n 阐释 姓名 作为 HMM 编号而不是名称。 编号从 0 开始。对于
例如,从名为的 HMM 数据库中获取第一个 HMM 富, 你会做
嗯2fetch -n 0 富。
使用 onworks.net 服务在线使用 hmm2fetch