这是命令 hmmlogo 可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行，例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序：
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hmmlogo - 给定 HMM，生成构建 HMM 徽标所需的数据
概要
标志 [选项]
商品描述
标志 计算可用于生成轮廓的字母高度和 indel 参数
HMM 标志。 这个工具本质上是一个用于大部分数据的命令行界面
Skylign 徽标服务器 (skylign.org) 的基础。
默认情况下， 标志 打印出每个位置的字母高度表（取决于
请求的高度方法），然后打印每个位置的间隙概率表。
在一个典型的标志中，一个位置的一叠字母的总高度取决于
位置的信息内容，堆栈高度根据
字母表中字母的发射概率。
配置
-h 帮助; 打印命令行用法和所有可用选项的简短提醒。
--height_relent_all
总高度 = 相对熵（又名信息量）； 所有的字母都有一个
正高度。 （默认）
--height_relent_abovebg
总高度 = 相对熵（又名信息量）； 只有上面的字母 -
背景概率被赋予正高度。
--身高分数
总高度=正分字母的分数总和； 字母高度取决于
那封信在那个位置的分数。 仅具有以上背景的字母
概率（正分）被赋予正高度。 （注意只有字母
高度是有意义的 - 堆栈高度没有内在意义）。
--no_indel
不要打印出 indel 概率表。
使用 onworks.net 服务在线使用 hmmlogo
