这是 ilink 命令，可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行，例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序：
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ilink - GEMINI 优化程序以找到 theta 向量的局部最优值
重组分数
概要
ILINK [选项] 文件 数据文件
商品描述
本手册页简要记录了 ILINK 命令。 事实上，这是一个非常原始的意图
提供联机帮助页，因为 Debian GNU/Linux 发行版要求每个程序
有一个联机帮助页。 任何增强都将受到极大的赞赏。
ILINK 是的一部分 快速链接 软件包。
ILINK 使用 GEMINI 优化程序找到 theta 的局部最优值
重组分数的向量。 如果您使用 lcp 生成的默认脚本，您的
θ 的初始猜测在每个维度上都是 1。 GEMINI 通过其评估每个 theta
可能性，寻求找到具有更高谱系可能性的 theta 向量。
GEMINI 过程有多次迭代。 每次迭代对应一行
输出。 每次迭代包括多个似然函数评估。 每次迭代
有两个阶段。 在第一阶段，GEMINI 寻求改进当前最好的 theta。 在第二阶段，
GEMINI 估计相对于当前最佳 theta 的似然梯度
向量。 在第一次迭代中，阶段 I 仅评估初始时的似然
候选 theta。
当ILINK打印出一行如：maxcensor can be reduction to -32767时，就已经完成了
第一次似然函数评估。 从长远来看，这个事实可以用来估计
运行时间。 函数评估数量的合理粗略估计是
10*（theta 向量的维数）。 theta 向量的维数为
在大多数情况下，比基因座的数量少一个。 如果允许maletheta和femaletheta
不同（sexdif 设置为 1），则维度数加倍为 2 *（数量
位点 - 1）。 估计其他参数（将 fitmodel 设置为 true）也可以增加
维数。
要了解更多有关 ILINK 读取文件可能很有用
/usr/share/doc/fastlink/README.ILINK 如果您有 Debian GNU/Linux 系统。
配置
可能有选项，但我没有找到有关它们的任何信息。 请转发
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使用 onworks.net 服务在线使用 ilink
