这是命令 macs2_bdgopt 可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行，例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序：
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macs2_bdgopt - 基于模型的 ChIP 测序分析
商品描述
用法：macs2 bdgopt [-h] -i IFILE [-m {乘，加，p2q}]
[-p [额外参数 [额外参数 ...]]] [--outdir OUTDIR] -o
文件
可选 参数：
-h, - 帮帮我
显示此帮助信息并退出
-i 文件， --i文件 文件
在 BedGraph 中的 MACS 分数。 注意：这必须是一个覆盖整个的bedGraph文件
基因组。 必需的
-m {相乘，相加，p2q}， - 方法 {相乘，相加，p2q}
修改bedGraph文件score栏的方法。 可用的选择是：
乘、加或 p2q。 1) 乘法，EXTRAPARAM 是必需的，将是
乘以分数列。 如果您打算将分数列除以 X，请使用
1/X 作为 EXTRAPARAM 的值。 2）添加，EXTRAPARAM是必需的，会被添加到
分数栏。 如果您打算用 X 减去分数列，请使用值 -X
作为 EXTRAPARAM。 3) p2q，这将使用 p 值分数转换为 q 值分数
本杰米尼-霍赫伯格过程。 不需要 EXTRAPARAM。 该方法假设
分数是 -log10 来自 MACS2 的 p 值。 任何其他类型的分数都会导致
意外错误。
-p [EXTRAPARAM [EXTRAPARAM ...]]， --额外参数 [额外参数 [额外参数 ...]]
METHOD 的额外参数。 检查细节 -m 选项。
--outdir 外向
如果指定，则所有输出文件都将写入该目录。 默认值：
当前工作目录
-o 文件， --o文件 文件
输出 BEDGraph 文件名。
使用 onworks.net 服务在线使用 macs2_bdgopt
