这是 macs2_bdgpeakcall 命令，可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行，例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序：
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macs2_bdgpeakcall - 基于模型的 ChIP 测序分析
商品描述
用法：macs2 bdgpeakcall [-h] -i IFILE [-c CUTOFF] [-l MINLEN] [-g 最大间隙]
[--截止分析] [--无轨迹线]
[--outdir OUTDIR] (-o 文件 | --o-前缀 前缀）
可选 参数：
-h, - 帮帮我
显示此帮助信息并退出
-i 文件， --i文件 文件
在 BedGraph 中的 MACS 分数。 必需的
-c 隔断， - 隔断 隔断
截止取决于您用于乐谱跟踪的方法。 如果文件包含
来自 MACS2 的 pvalue 分数，分数 5 表示 pvalue 1e-5。 默认值：5
-l 敏伦， --最小长度 民伦
峰的最小长度，最好将其设置为 d 值。 默认值：200
-g 最大差距， --最大间隙 最大差距
峰值中重要点之间的最大间隙，最好将其设置为标签大小。
默认值：30
--截止分析
设置后，bdgpeakcall 将分析可以被识别的峰的数量或总长度
通过不同的截止值调用然后输出一个汇总表以帮助用户决定一个更好的
隔断。 请注意， minlen 和 maxgap 可能会影响结果。 默认值：错误
--无轨迹线
告诉 MACS 不要在 bedGraph 文件中包含轨迹线。 轨迹线为必填项
通过 UCSC。
--outdir 外向
如果指定，则所有输出文件都将写入该目录。 默认值：
当前工作目录
-o 文件， --o文件 文件
输出文件名。 与互斥 --o-前缀.
--o-前缀 前缀
输出文件前缀。 与互斥 -o/--文件。
使用 onworks.net 服务在线使用 macs2_bdgpeakcall
