这是 masai_output_pe 命令，可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行，例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
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masai_output_pe - 马赛输出 - 配对结束模式
概要
masai_output_pe [选项]
商品描述
Masai 是一种基于近似种子和多个的快速准确的读取映射器
回溯。
我们 http://www.seqan.de/projects/masai 获取更多信息.
(c) 版权所有 2011-2012 由 Enrico Siragusa。
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配对选项：
-ng, --无间隙
不要将读取与间隙对齐。
-二, --库长度 民
库长度。 默认值：220。
-这, --图书馆错误 民
文库长度公差。 默认值：50。
输出选项：
-t, --tmp-文件夹 STR
指定一个巨大的临时文件夹。 默认：使用基因组文件夹。
-o, - 输出文件 文件
指定输出文件。 默认值：使用读取文件名前缀。 有效的文件类型
分别是：raw 和 sam。
-NC, --无雪茄
不输出 CIGAR 字符串。 这仅影响 SAM 输出。
调试选项：
-nd, --无转储
不要转储结果。
VERSION
masai_output_pe 版本：0.7.1 [14053] 最后更新 2013-05-16
使用 onworks.net 服务在线使用 masai_output_pe
