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minclookup - 在 minc 文件上执行查找表转换

概要

最小查找 [ ] .mnc .mnc

商品描述

最小查找 将对 minc 文件的每个体素执行查找表操作。 查找
表由具有匹配输出值的输入值列表组成。 的每个体素
在查找表中找到输入文件并写出相应的输出值。
这些输出值可以是标量值或向量值，例如，颜色查找
表将有四列：一列用于输入值，每一列用于红色，
绿色和蓝色输出值。

查找表可以采用以下两种形式之一： 连续 or 离散的.

连续查找表用于将体素值视为连续（真实）值和
通过在查找表中给出的值之间进行插值来转换值。 一种
离散查找表将输入值视为整数并完全处理它们
独立条目，不进行插值。

连续查找表最常见的用途是将强度值转换为
RGB 颜色。 为了使查找表更简单，输入值都被重新调整为
范围从零到一。 默认情况下，文件中的最小值映射为零和最大值
映射到一个。 然后在查找表中找到这个值，通常在两个条目之间
表（表总是按输入值的升序排序）。 线性
然后在每个输出列上进行插值，结果值（或多个值）是
写入输出文件。 如果每个输入值有多个输出值，则
维度 vector_dimension 被添加到输出文件，长度等于数字
查找表中的输出列。 对于零到一范围之外的输入值，
使用最接近的表值。

离散查找表通常用于重新映射标签值。 每个输入值是
视为整数（不重新缩放），如果在查找表中找到，则
相应的值（或多个值）被写入输出文件。 如果没有找到，
然后写出一个空值（默认为零）。 不使用离散进行插值
查找表 - 要获得非空输出值，表中必须有一个条目。

配置

请注意，可以以缩写形式指定选项（只要它们是唯一的）和
可以在命令行的任何地方给出。

总类 选项

-2 创建一个 MINC 2.0 格式的输出文件。

-破坏者
覆盖现有文件。

-noclobber
不要覆盖现有文件（默认）。

-no_clobber
同义词 -noclobber.

-冗长
打印出复制的每个数据块的进度信息（默认）。

-安静的 不要打印出进度信息。

-缓冲区大小 尺寸
指定内部缓冲区的最大大小（以千字节为单位）。 默认值为 10 MB。

-文件类型
创建一个与第一个输入文件类型相同的输出文件（默认）。

-字节 将每个体素存储为 8 位整数。

-短 将每个体素存储为 16 位整数。

-int 将每个体素存储为 32 位整数。

-长 被取代 -int.

-漂浮 以 32 位浮点格式存储每个体素。

-双
以 64 位浮点格式存储每个体素。

-签
使用以签名类型存储的数据创建输出文件。 这个选项没有意义
与始终带符号的浮点数据格式一起使用时。

-未签名
使用以无符号类型存储的数据创建输出文件。 这个选项是
与浮点数据格式一起使用时毫无意义。

-有效范围 分钟 最大
缩放整数体素值以落在值之间 分钟 和 最大. 默认情况下
整数体素值将被缩放以使用基本类型的整个范围。 这个
选项在与浮点数据格式一起使用时毫无意义。

查找 表 选项

-灰色 使用灰色查找表写出 RGB 值（默认）。

-灰色 同义词 -灰色.

-热金属
使用热金属查找表写出 RGB 值。

-光谱
使用光谱（彩虹）查找表写出 RGB 值。

-倒置
反转查找表，使最大值映射为零和最小值
值映射到一个。 仅适用于连续查找表。

-不反转
不要反转查找表 - 最小值映射到零，最大值映射到
一（默认）。

-范围 分钟 最大
指定应映射到查找表范围的值范围
（默认是输入文件的完整范围）。

-最低限度 分钟
指定映射到查找表中最小值的输入值。

-最大值 最大
指定映射到查找表中最大值的输入值。

-查找表 [文件 | -]
指定包含查找表的文件的名称。 如果 - 给定，查找
table 从标准输入中读取。 该文件必须至少有两列：
第一列给出输入值； 其他列给出相应的
输出值。 对于连续查找表，第一列应包含
零和一之间的值 零和一的显式条目应该
通常会给。 对于离散查找表，第一列应包含
整数值。 如果给出了多个输出列，则输出文件将
有维度 矢量维度 长度等于输出的数量
列。 如有必要，将对表格的行进行排序，以便第一个
列按升序排列。

-lut_字符串 查找表字符串
将完整的查找表指定为单个字符串。 分号字符“;”
用于分隔线。

-连续
查找表是连续的（见上面的描述）：输入值被视为
连续（实数）值，并在被重新缩放到 XNUMX 到 XNUMX 的范围之前
抬起头来； 在表中的值之间进行插值。 这是默认的
行为。

-离散的
查找表是离散的（见上面的描述）：输入值被视为
整数，并且在输入值之间不进行插值。

-空值 空值字符串
指定一个空值，当某个值不存在时用于离散查找表
在查找表中找到。 此值必须指定为逗号分隔的列表
值，具有与查找表中的输出列相同数量的值。

通用 选项 所有 命令：

-救命 打印命令行选项的摘要并退出。

-版
打印程序的版本号并退出。

示例

要从 MRI 文件中获取热金属 RGB 图像：

minclookup -hotmetal input.mnc 输出.mnc

要转换 minc 标签文件中的标签，请使用 -discrete：

minclookup -discrete -lookup_table 查找文件 \
输入标签.mnc 输出标签.mnc

其中，lookupfile 是一个包含将标签 2 映射到 4 以及标签 3 到 5 的条目的文件：

2 4
3 5

您还可以在命令行上指定此查找表：

minclookup -discrete -lut_string '2 4;3 5' \
输入标签.mnc 输出标签.mnc

获取灰色 RGB 文件，红色表示小于最小值的值，绿色表示值
大于最小值，您可以给出两个零条目和两个一条目。 首先
零用于负值，第二个零用于插值到下一个
入口。 关于如何处理恰好为零的值没有歧义，因为第一个
表的最后一个值以特殊方式处理以确保它们是
如果发生这种二次进入的情况，则视为在范围内。

minclookup -lookup_table - input.mnc output.mnc <
0 1 0 0
0 0 0 0
1 1 1 1
1 0 1 0
EOF

要反转标量图像，您可以使用 minclookup：

minclookup -lut_string '0 1;1 0' in.mnc out.mnc

使用 onworks.net 服务在线使用 minclookup