这是命令 subread-buildindex 可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行，例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序：
您的姓名
subread-buildindex - 使用参考构建基础空间或颜色空间索引
序列
用法
子读构建索引 [选项] -o {FASTA 文件 1} [FASTA 文件 2] ...
必需的参数：
-o
要创建的索引的基本名称
可选参数：
-F 为参考基因组建立一个完整的索引。 16bp 的 subreads 将从
参考基因组的每个位置。 索引的大小通常是
使用默认设置构建的索引的大小。
-B 创建一个索引块。 构建的索引不会被拆分成多个部分。
这使得运行对齐时请求的内存量最大，但
它可以实现最大的映射速度。 此选项覆盖 -M ，尤其是
它也提供。
-M
请求的内存（RAM）的大小（以兆字节为单位），默认为 8000。
-f
指定删除无信息子读数的阈值（高度重复的 16mers
在参考）。 默认为 100。
-c 建立色彩空间索引。
-v 程序的输出版本。
有关这些参数的更多信息，请参阅用户手册。
子阅读- 1.5.0-p1+dfsg-2
使用 onworks.net 服务在线使用 subread-buildindex
