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tcodee - 云端在线

通过 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行 tcodee

这是可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行的命令 tcodee,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器

程序:

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tcode - 使用 Fickett TESTCODE 统计识别蛋白质编码区域

概要


t码 -序列 后继 -数据文件 数据文件 -窗口 整数 -step 整数 -阴谋 切换
-输出文件 报告 -图形 xy图

t码 -救命

商品描述


t码 是来自 EMBOSS(“欧洲分子生物学开放软件
套房”)。 它是“核:基因发现”命令组的一部分。

配置


输入 部分
-序列 后继

-数据文件 数据文件
默认数据文件是 Etcode.dat 并包含每个碱基的编码概率。
概率适用于位置和成分信息。 默认
值:Etcode.dat

其他要求 部分
-窗口 整数
这是 TESTCODE 统计的核苷酸碱基数
每次都执行。 然后窗口将沿着序列滑动,覆盖相同的
每次的碱基数。 默认值:200

先进的 部分
-step 整数
默认情况下,选定的窗口将沿着核苷酸序列滑动三个
一次碱基,保留框架(尽管该算法对框架不敏感)。
这可以更改以增加或减少幻灯片的增量。 默认值:
3

输出 部分
-阴谋 切换
选择序列图(X 轴)与编码分数(Y
轴)将显示。 绿线上方为编码,红线下方为
行是非编码的。 默认值:N

-输出文件 报告

-图形 xy图

使用 onworks.net 服务在线使用 tcodee


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