这是命令 TransDecoder.Predict 可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行，例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序：
您的姓名
Transdecoder - 转录组蛋白质预测
用法
证据需求：
-t 成绩单.fasta
常用选项：
--retain_long_orfs 保留所有发现的等于或长于这些核苷酸的 ORF，即使没有其他证据
将其标记为编码（默认：900 bp => 300aa）
--retain_pfam_hits /path/to/pfam_db.hmm 进行搜索
使用 hmmscan（应该可以通过您的 PATH 设置访问）
--retain_blastp_hits
高级选项
- 火车带有 ORF 的 FASTA 文件以训练 Markov Mod 进行蛋白质识别； 除此以外
使用的最长非冗余 ORF
-T 如果没有 --train，则训练马尔可夫模型的最长 ORF（六聚体统计数据）（默认值：500）
2015-12-28 转码器.预测(1)
使用 onworks.net 服务在线使用 TransDecoder.Predict
