这是命令 tree_recon 可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序:
您的姓名
tree_recon - 树重建
概要
tree_recon [选项] -m 远距离
商品描述
从 Phylip 矩阵 IN.DIST 重建系统发育树。
-h, - 帮帮我
显示此帮助消息。
- 版
显示版本信息
输入/输出:
-m, - 矩阵 文件
命名 Phylip 距离矩阵文件。 必须至少包含三个物种。 有效的
文件类型是:dist。
-o, --输出文件 文件
将输出写入的路径。 有效的文件类型是:dot 和 newick。 默认值:tree.dot。
算法选项:
-b, - 建造 方法
造树方法。 nj:邻居加入,最小值:UPGMA 单链接,最大值:UPGMA
完整链接,avg:UPGMA 平均链接,wavg:UPGMA 加权平均链接。
邻居加入创建一个无根树。 我们至少连接那棵树
一对。 nj、min、max、avg 和 wavg 之一。 默认值:nj。
联系方式和参考
如有问题或意见,请联系:
托拜厄斯·劳施[email protected]>
SeqAn主页:
http://www.seqan.de
VERSION
tree_recon 版本:1.02 最后更新 17 年 2012 月 XNUMX 日
使用 onworks.net 服务在线使用 tree_recon
