这是名为 BIRAP 的 Linux 应用程序，其最新版本可作为 Sample_Files.zip 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
免费下载并在线运行这个名为 BIRAP with OnWorks 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序，安装并运行。
SCREENSHOTS
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比拉普
商品描述
BIRAP（细菌基因间区域分析管道）是一个开源的、易于使用的 Perl 管道，可用于使用实验数据重新注释细菌基因组。 该工具集成了源自 RNA-seq 和/或蛋白质组学的表达谱，将其与现有的计算机注释进行比较，并帮助验证注释、识别新的蛋白质编码区域、推定的非编码 RNA 以及帮助纠正现有注释中的错误. 该管道需要来自 SAMtools 的“堆积”输出，用于 RNA-seq 数据和来自 Proteogenomic Mapping 工具的肽/ePST 基因座文件 (GFF)，用于蛋白质基因组学数据以及基因组和计算机注释。 当提供有关基因组中启动子和终止子基因座的信息（.coords 格式）时，该管道还将有助于识别非编码 RNA。
特性
- 细菌基因组的基因间区域分析
- 细菌基因组的重新注释
- 小 RNA (sRNA) 检测
- RNA序列
- 蛋白质组学
目的
学术/科研
用户界面
控制台/终端，命令行
程式语言
Perl的
分类
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/birap/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便通过我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
