这是名为 CpDB 的 Linux 应用程序,其最新版本可以下载为 CpDB.20150623.static.zip。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
免费下载并在线运行这个名为 CpDB with OnWorks 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
数据库
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商品描述
该软件允许我们在 PostgreSQL 中创建一个关系数据库,用于存储完整的细菌基因组。除了数据库之外,还有一些软件(例如解析器)可以将 EMBL 或 GBK 文件转换为 CpDB 关系模式。一旦进入 CpDB,就可以使用 SQL 从细菌基因组中提取无限量的报告。该软件是 Anderson Santos 生物信息学博士学位课程的一部分(https://orcid.org/0000-0003-3418-0823)是在假结核棒状杆菌(Cp)泛基因组项目下开发的。Cp泛基因组在2009年至2012年间向科学界提供了XNUMX株细菌,并将它们存储在GenBank数据库中。该论文以巴西葡萄牙语撰写。不过,该软件的英文版书籍章节可从以下网址获取: https://doi.org/10.5772/23724。CpDB 是 Pannotator 软件的支柱: https://pannotator.facom.ufu.br. 这两款软件仍然活跃。
好好享受。
目的
学术/科研
程式语言
C、PL/SQL
数据库环境
PostgreSQL (pgsql)
分类
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/cpdb/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。