这是一款名为 GenOO-HTS 的 Linux 应用程序,可在 Linux 在线运行,其最新版本可作为 genoo-code-2013_04_18.tar.gz 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
下载并在线运行这款名为 GenOO-HTS 的应用程序,可免费使用 OnWorks 在 Linux 中在线运行。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
SCREENSHOTS
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GenOO-HTS 在 Linux 上在线运行
商品描述
GenOO-HTS [jee-noo] 是一个开源软件; 面向对象的 Perl 框架专门为设计高通量测序 (HTS) 分析工具而开发。 GenOO-HTS 的主要目标是使简单的 HTS 分析变得容易并使复杂的分析成为可能。 GenOO-HTS 将生物实体建模为 Perl 对象,并提供相关属性和方法,允许操作高通量测序数据。 使用 GenOO-HTS 作为核心开发模块降低了管理数据和手头生物实体的开销和复杂性。 GenOO-HTS 被设计为灵活、易于扩展,具有模块化结构和对外部工具和库的最低要求。功能
- 将生物实体组织为 perl 对象(基因组区域、基因、转录本、内含子/外显子等)
- 将测序实体组织为 perl 对象/属性(测序读取、比对等)
- 使来自广泛使用的文件格式(SAM、BED、FASTA、FASTQ)的 I/O 变得容易
- 保持一致且易于扩展
目的
科学/研究,开发人员
程式语言
Perl的
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/genoo/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。