这是名为 GMATA 软件的基因组 SSR 标记的 Linux 应用程序,其最新版本可以作为 GMATAv2.2.jar 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 GMATA 软件的用于基因组 SSR 标记的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
SCREENSHOTS
Ad
用于基因组 SSR 标记的 GMATA 软件
商品描述
什么是软件 GMATA v21
Genome-wide Microsatellite Analyzing Toward Application (GMATA) 是一种用于简单序列重复 (SSR) 分析、SSR 标记设计和在任何 DNA 序列中作图的软件。 它具有以下功能:
1、SSR挖矿;
2. 统计分析和绘图;
3. SSR轨迹图查看;
4、标志设计;
5. 电子测绘和标记可转移性调查。
GMATA 准确、灵敏且快速。 它旨在处理大型基因组序列数据集,尤其是大型全基因组序列。 理论上,任何大小的基因组都可以通过 GMATA 轻松分析。 软件 GMATA 可在服务器、台式机甚至笔记本电脑上运行,只需单击即可在图形界面中运行,也可以在命令行或自动管道中运行。 它也是跨平台的,支持 Unix/Linux、Win 和 Mac。 来自软件 GMATA 的结果可以在 Gbrowser 中与基因组或基因特征一起直接以图形方式显示,并且可以轻松地与任何基因组数据库集成。
特征
- 在任何大序列中准确和最快的 SSR 挖掘
- 完整的统计分析和绘图
- SSR 位点和标记图形显示在 Gbrowser 中,具有基因组特征
- 特异性 SSR 标记设计和模拟 PCR
- 电子测绘和标记可转移性调查
- 也可在 https://github.com/XuewenWangUGA/GMATA.git
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/gmata/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。