这是名为 GMcloser 的 Linux 应用程序,其最新版本可以作为 GMcloser-1.6.2.tar.gz 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 GMcloser 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
通用关闭器
Ad
商品描述
GMcloser 填补并弥补了支架组装中存在的空白,尤其是那些由具有下一代测序 (NGS) 读数的全基因组从头组装产生的空白。 与其他仅使用 NGS 读取的间隙关闭工具不同,GMcloser 使用预组装的 contig 集或长读取集作为关闭间隙的序列,并使用配对末端 (PE) 读取和基于似然的算法来提高间隙的准确性和效率关闭。 间隙闭合的效率可以通过使用不同重叠群集的连续处理来提高。附带的包 GMvalue 是确定重叠群和支架中错误组装位点的工具。 与其他相关工具不同,GMvalue 可以通过多种选项定义错误组装类别,并且可以应用于大型基因组的组装。 通过使用 -e 选项,GMvalue 还可以通过拆分或纠正错误组装来生成无错误的程序集。
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/gmcloser/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。