这是名为 Just_Preprocess_My_Reads 的 Linux 应用程序,其最新版本可以下载为 justpreprocessmyreads_Aug2015c.tar.gz。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 Just_Preprocess_My_Reads 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
Just_Preprocess_My_Reads
Ad
商品描述
以标准方式识别 rRNA、污染物、修剪等。保持读取对。 专为即发即忘的高吞吐量项目(TB 级数据)而构建。
使用 pbzip2、bowtie2、fastx_toolkit、samtools、fastqc、Trimmomatic(可选)
特征
- 光照预处理
- 污染检查
目的
学术/科研
分类目录
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/justpreprocessmyreads/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。