这是名为 kallisto 的 Linux 应用程序，其最新版本可以下载为 kallisto_windows-v0.50.0.zip。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 kallisto 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序，安装并运行。
SCREENSHOTS
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卡利斯托
商品描述
kallisto 是一个程序，用于从 RNA-Seq 数据或更一般地使用高通量测序读数对目标序列进行近乎最佳量化的转录本丰度。 它基于使用伪对齐来快速确定读取和目标的兼容性的想法，无需对齐。
根据在 Mac 台式计算机上进行的基准测试，kallisto 可以在不到 30 分钟的时间内量化 3 万条人类批量 RNA-seq 读取，仅使用读取序列和转录组索引，这本身可能需要 10 多分钟的时间来构建。 由于它使用伪对齐，因此它对读取中的错误具有鲁棒性，并保留了量化所需的关键信息。 这使得 kallisto 不仅速度快，而且准确度也很高。 在许多基准测试中，它甚至大大优于现有工具。
功能
- 使用伪对齐
- 快速准确
- 可以使用 sleuth 分析定量的大量 RNA-Seq
- 可与 bustools 一起使用来预处理单细胞 RNA-seq 数据
程式语言
C
分类
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/kallisto.mirror/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便通过我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
