这是一个名为 locusvu 的 Linux 应用程序,可在 Linux 在线运行,其最新版本可以作为 LocusVu.tar.gz 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
下载并在线运行这个名为 locusvu 的应用程序,可免费使用 OnWorks 在 Linux 中在线运行。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
SCREENSHOTS
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locusvu 在 Linux 上在线运行
商品描述
LocusVu 是一种基于 Java 的新型软件工具,它接受基因组位点列表(染色体上的位置)作为输入,并自动从公共数据库(例如 UCSC 基因组浏览器)获取相关信息(细胞遗传带、基因名称、OMIM 数据等)数据库。 然后,它可以针对检索到的结果启用多个工作流程,例如比较多个数据集(比较基因组学)、从工具本身内查看基因座的相邻基因,或在条形图/饼图中以图形方式表示这些结果。 LocusVu 在前端有一个简单易用的 GUI,可以让用户与底层逻辑进行直观的交互。该工具可以轻松扩展以添加对其他数据库(例如 Ensembl)的支持或获取信息
来自数据库中的其他表。 因此,LocusVu 提供了一个基本框架,用户和开发人员都可以使用它来简化现有工作流程并创建更新的工作流程以支持基因组学中的数据分析。
特征
- 自动从数据库中检索数据(目前是 UCSC 基因组浏览器数据库)
- 对检索到的结果启用工作流,例如..
- ..比较多个数据集(比较基因组学)
- ..查看基因座的相邻基因(从工具本身内部)
- ..以图形方式表示结果(条形图/饼图)
- 前端易于使用的 GUI,可直观使用
- 使用 Log4j 记录日志以便于调试
- 易于扩展
目的
科学/研究,开发人员
用户界面
Java秋千
程式语言
爪哇岛
数据库环境
MySQL的
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/locusvu/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。