这是一款名为 miRDP2 的 Linux 应用程序,可在 Linux 在线运行,其最新版本可以下载为 miRDP2-v1.1.4.tar.gz。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
下载并在线运行这个名为 miRDP2 的应用程序,可免费在 Linux 上运行 OnWorks。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
miRDP2 在 Linux 上在线运行
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商品描述
miRDeep-P2 (miRDP2) 旨在准确快速地分析植物中的 microRNA (miRNA) 转录组。 它是从 miRDeep-P (miRDP) 中采用的,具有新的策略和改进的算法。 我们已经测试了 miRDP2 以分析基因组大小逐渐增加的植物(如拟南芥、水稻、番茄、玉米和小麦)中的 miRNA 转录组。 与 miRDeep-P 和其他几种计算工具相比,miRDP2 处理 NGS 数据的速度更快。 通过纳入新更新的植物 miRNA 注释标准,miRDP2 的准确性也显着提高。 我们的结果表明 miRDP2 是一种快速准确的分析植物 miRNA 转录组的工具。文献参考: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bty972
功能
- 小RNA
- 微小RNA(miRNA)
- 下一代测序(NGS)
- Perl的
目的
学术/科研
程式语言
Perl的
数据库环境
Perl DBI/DBD
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/mirdp2/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。