这是名为 MSL 的 Linux 应用程序，可在 Linux 在线运行，其最新版本可以作为 mslib-1.1.0.9.tgz 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
下载并在线运行这个名为 MSL 的应用程序，可免费使用 OnWorks 在 Linux 中在线运行。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序，安装并运行。
MSL 在 Linux 上在线运行
Ad
商品描述
MSL 是一个 C++ 库，可用于大分子的计算研究。MSL 库不是程序（尽管有些应用程序是分布式的），而是科学家编写自己的分子建模方法的工具。
理念
主要目标是创建一组工具，使大分子的计算研究能够在各个层面相对轻松地进行，从简单的操作（例如，加载 PDB 并测量距离或编辑二面角）到复杂的应用程序（蛋白质建模或设计）。
MSL 由威斯康星大学麦迪逊分校的 Senes 实验室和来自其他研究实验室的开发人员/用户团队开发。
文献参考：
Kulp DW、Subramaniam S、Donald JE、Hannigan BT、Mueller BK、Grigoryan G、Senes A.
使用开源分子软件库 (MSL) 进行结构信息学、建模和设计。
J 计算化学。 2012年卷。 33 页 1645-61
下载文章在 http://dx.doi.org/10.1002/jcc.22968
特性
- 在多个原子坐标之间存储和切换的能力，用于侧链构象自由的构象变化和旋转异构表示。
- 在一个位置建立和存储多个残基标识（即 LEU、ILE、ALA）并在它们之间切换的能力。
- # CHARMM 力场和其他能量函数。
- 转换，例如平移、旋转和对齐。
- Monte Carlo、Dead End Elimination、Self Consistent Mean Field Monte Carlo等搜索算法，骨干采样
- 晶格生成。
- 支持旋转异构体库
- 主干修改和生成
- 支持平台：Linux、MacOS
目的
学术/科研
程式语言
C + +中
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/mslib/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
